RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 FXNQ16595 210 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 C1orf140Q5VVS0 124 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 OR2A2Q6IF42 318 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 BTLAQ7Z6A9 289 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNF128Q8TEB7 428 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 STARD4Q96DR4 205 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC47A1Q96FL8 570 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZFP3Q96NJ6 502 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 POTEKPQ9BYX7 375 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 KCNJ16Q9NPI9 418 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC7A7Q9UM01 511 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 V9GYQ6 96 aa15.58■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 A0A087WUJ7 227 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 LIPT2A6NK58 231 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARPC2O15144 300 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLGP00747 810 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 PNMTP11086 282 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 FCGR2AP12318 317 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 OPRM1P35372 400 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 RPS5P46782 204 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAP2K6P52564 334 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 CBX1P83916 185 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 TFF3Q07654 80 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF613Q6PF04 617 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 FKBP9P1Q75LS8 142 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 TUSC5Q8IXB3 177 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 LZICQ8WZA0 190 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 TAAR8Q969N4 342 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTDSS2Q9BVG9 487 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 SFXN3Q9BWM7 321 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 C1orf21Q9H246 121 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 C12orf10Q9HB07 376 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 SELENONQ9NZV5 590 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 KLHL13Q9P2N7 655 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRAPPC4Q9Y296 219 aa15.57■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRAPPC13A5PLN9 417 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 J3KTA2 159 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRKD3O94806 890 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 AKR7A3O95154 331 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 IL18BPO95998 194 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 CBLP22681 906 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 IDUAP35475 653 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 BNIP1Q12981 228 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 LINC00114Q6XXX2 140 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 GDF7Q7Z4P5 450 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 LUZP2Q86TE4 346 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 MCEMP1Q8IX19 187 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 STK35Q8TDR2 534 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC25A36Q96CQ1 311 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC41A3Q96GZ6 507 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 THTPAQ9BU02 230 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 GORASP2Q9H8Y8 452 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 RHCGQ9UBD6 479 aa15.56■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 CYTIPO60759 359 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 GMNNO75496 209 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 TAS2R41P59536 307 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC35A1P78382 337 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 H3F3AP84243 136 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 MS4A2Q01362 244 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 IFI44LQ53G44 452 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 CYP2R1Q6VVX0 501 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM214BQ7L5A3 538 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 NKAIN4Q8IVV8 208 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM99Q8N816 258 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 PSD2Q9BQI7 771 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRSS27Q9BQR3 290 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 SEC14L4Q9UDX3 406 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 RIMS3Q9UJD0 308 aa15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRRN3E7EW58 273 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 GYG2O15488 501 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHP2O43745 196 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 CGAP01215 116 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPIP06744 558 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 CRHP06850 196 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATP6V1B2P21281 511 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 AGTR1P30556 359 aa15.54■□□□□ 0.08
CCNDBP1-204ENST00000563065 CTBP2P56545 445 aa15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms