RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560715.5

TSPAN3-209, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN3, Length 2,892 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-209ENST00000560715 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 PYURFQ96I23 114 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 LGMNQ99538 433 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 KATNBL1Q9H079 304 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 NPTNQ9Y639 398 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 KCNK1O00180 336 aa6.2□□□□□ -1.42
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TSPAN3-209ENST00000560715 LAP3P28838 519 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 SDC2P34741 201 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 MMP12P39900 470 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 NUDT6P53370 316 aa6.2□□□□□ -1.42
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TSPAN3-209ENST00000560715 PPP3R1P63098 170 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 ARHGAP1Q07960 439 aa6.2□□□□□ -1.42
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TSPAN3-209ENST00000560715 GPR176Q14439 515 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 PCID2Q5JVF3 399 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 CNIH2Q6PI25 160 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 Q6ZS46 218 aa6.2□□□□□ -1.42
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TSPAN3-209ENST00000560715 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 P2RY11Q96G91 374 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 SIK2Q9H0K1 926 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 MED20Q9H944 212 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 TREM2Q9NZC2 230 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 MED11Q9P086 117 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 PISDQ9UG56 409 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 CITO14578 2027 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 A0A0U1RQF3 1178 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 RAD1O60671 282 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 POMCP01189 267 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 GJA1P17302 382 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 TNFSF9P41273 254 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 RGS4P49798 205 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 ACLYP53396 1101 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
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TSPAN3-209ENST00000560715 DHODHQ02127 395 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 MXD1Q05195 221 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 SLC3A1Q07837 685 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 DOC2BQ14184 412 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 NCF4Q15080 339 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 P2RY14Q15391 338 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 ACER2Q5QJU3 275 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.19□□□□□ -1.42
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TSPAN3-209ENST00000560715 SERINC5Q86VE9 423 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF567Q8N184 647 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 OR10A6Q8NH74 314 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 PPTC7Q8NI37 304 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 NEU1Q99519 415 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 GHRLQ9UBU3 117 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 A0A1W2PQY0 241 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 FFAR3O14843 346 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 SIGLEC5O15389 551 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 GPR42O15529 346 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 PLPP2O43688 288 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 ZNF217O75362 1048 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 ECI2O75521 394 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 AP2A2O94973 939 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 CRYBA1P05813 215 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 GYPEP15421 78 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 CD79BP40259 229 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 TSPAN5P62079 268 aa6.19□□□□□ -1.42
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TSPAN3-209ENST00000560715 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 ILKQ13418 452 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 UQCC3Q6UW78 93 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 NAXDQ8IW45 347 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 OR2T11Q8NH01 316 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 FN3KQ9H479 309 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TSPAN3-209ENST00000560715 PHYHO14832 338 aa6.18□□□□□ -1.42
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