RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 CT55Q8WUE5 264 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYGBQ8WWM9 190 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 CNBD2Q96M20 576 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF570Q96NI8 536 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC46A1Q96NT5 459 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF347Q96SE7 839 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIP5K1AQ99755 562 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRSS22Q9GZN4 317 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 WWTR1Q9GZV5 400 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF350Q9GZX5 532 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 THSD1Q9NS62 852 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 KLHL28Q9NXS3 571 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 FLRT3Q9NZU0 649 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 CFL2Q9Y281 166 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 NTNG1Q9Y2I2 539 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 PADI2Q9Y2J8 665 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 AP4B1Q9Y6B7 739 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 ENPP4Q9Y6X5 453 aa5□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTPRBP23467 1997 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 FRG2CA6NGY1 282 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 AGAP5A6NIR3 686 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 AP3D1O14617 1153 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADAMDEC1O15204 470 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 GMFGO60234 142 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 MITFO75030 526 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 REM1O75628 298 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 UGT2B17O75795 530 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 TNFSF15O95150 251 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 SNAP29O95721 258 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 ONECUT2O95948 504 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 LGI1O95970 557 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGKV3-11P04433 115 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 UMODP07911 640 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 GKN3PP0CG01 181 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 THRBP10828 461 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYP4B1P13584 511 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 UQCRBP14927 111 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 RHCEP18577 417 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 TCN2P20062 427 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGFBP5P24593 272 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 IL12BP29460 328 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRKAR1BP31321 381 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRT20P35900 424 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIGAP37287 484 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAP3K8P41279 467 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPICP45877 212 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 HSPA13P48723 471 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 ALDH3A2P51648 485 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 TAS2R41P59536 307 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLCXD2Q0VAA5 305 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 EBPQ15125 230 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 NPTX1Q15818 432 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 DECR1Q16698 335 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 NDUFAF6Q330K2 333 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 IQCCQ4KMZ1 466 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 EIPR1Q53HC9 387 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPP4R4Q6NUP7 873 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 HSDL2Q6YN16 418 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 GLRX5Q86SX6 157 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 GALNT16Q8N428 558 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 PACRGLQ8N7B6 248 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATG16L2Q8NAA4 619 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 C7orf57Q8NEG2 295 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 B3GNT7Q8NFL0 401 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR10G2Q8NGC3 310 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR9Q2Q8NGE9 314 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR6T1Q8NGN1 323 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 GIPC3Q8TF64 312 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF597Q96LX8 424 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRFN5Q96NI6 719 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 BTBD9Q96Q07 612 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 EPYCQ99645 322 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 LPAR4Q99677 370 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 MCHR1Q99705 422 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARHGDIGQ99819 225 aa4.99□□□□□ -1.61
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZPBPQ9BS86 351 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms