RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558804.5

APBA2-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 2, human

TSL 4

Gene APBA2, Length 535 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA2-208	ENST00000558804	C10orf82	Q8WW14	230 aa		11.12	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	MED18	Q9BUE0	208 aa		11.12	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		11.12	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		11.12	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		11.12	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		11.12	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		11.12	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		11.12	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	LIPT2	A6NK58	231 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	ZNF208	O43345	1280 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	PLAU	P00749	431 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	ADA	P00813	363 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	IGHV3-9	P01782	118 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	OPN1SW	P03999	348 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	ETS2	P15036	469 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	PTN	P21246	168 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	FPR1	P21462	350 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	OR3A2	P47893	321 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	ARFIP2	P53365	341 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	KEAP1	Q14145	624 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	RABL3	Q5HYI8	236 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	REEP3	Q6NUK4	255 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	P3H2	Q8IVL5	708 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	SLC43A2	Q8N370	569 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	S100PBP	Q96BU1	408 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	GP6	Q9HCN6	339 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		11.11	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	ZNF724	A8MTY0	619 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804		H7C1Q1	480 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	MFN2	O95140	757 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	AKR7A3	O95154	331 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	IGHV1-2	P23083	117 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	PRKAR1B	P31321	381 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	HTR3A	P46098	478 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	NFYC	Q13952	458 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	CEACAM7	Q14002	265 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	GNA13	Q14344	377 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	NPTX1	Q15818	432 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	DUSP7	Q16829	419 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	REP15	Q6BDI9	236 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	BEND4	Q6ZU67	534 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	TMEM99	Q8N816	258 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	SMYD1	Q8NB12	490 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	PIF1	Q9H611	641 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	ARMCX1	Q9P291	453 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	IFT52	Q9Y366	437 aa		11.1	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804		A0A1B0GWA3	101 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	C5orf58	C9J3I9	102 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804		M0R3H8	397 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	ANGPT2	O15123	496 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	LYZL6	O75951	148 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	LYPD3	O95274	346 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	THY1	P04216	161 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	CD247	P20963	164 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	SLC16A1	P53985	500 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	LGALS3BP	Q08380	585 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	SLC17A1	Q14916	467 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	PDK3	Q15120	406 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	OR7A5	Q15622	319 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	SNX32	Q86XE0	403 aa		11.09	□□□□□ -0.63
APBA2-208	ENST00000558804	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		11.09	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms