RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556355.5

SRP54-AS1-203, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 603 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-203ENST00000556355 FRMPD3Q5JV73 1810 aa3.41□□□□□ -1.86
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CFAP74Q9C0B2 1584 aa3.41□□□□□ -1.86
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa3.41□□□□□ -1.86
SRP54-AS1-203ENST00000556355 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa3.41□□□□□ -1.86
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa3.4□□□□□ -1.86
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
SRP54-AS1-203ENST00000556355 A0A1B0GWB2 263 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 K7ENP7 123 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HIP1O00291 1037 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 STSP08842 583 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC35E2P0CK97 266 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ETS2P15036 469 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TNNI1P19237 187 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GALP22466 123 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CD1CP29017 333 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LEPP41159 167 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CRYBB2P43320 205 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KIR2DS2P43631 304 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ATP5OP48047 213 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 STARP49675 285 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PKNOX1P55347 436 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RIPK4P57078 832 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC8A3P57103 927 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ASAH1Q13510 395 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC1A5Q15758 541 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HSDL2Q6YN16 418 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GDPD3Q7L5L3 318 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR2L2Q8NH16 312 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ARNTL2Q8WYA1 636 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RAPGEF5Q92565 580 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MCHR1Q99705 422 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TRIM62Q9BVG3 475 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SCAPERQ9BY12 1400 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 REEP4Q9H6H4 257 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KLHL28Q9NXS3 571 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ABCG2Q9UNQ0 655 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.4□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PCNX3Q9H6A9 2034 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 POGZQ7Z3K3 1410 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 A0A1B0GUS0 222 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UPK3AO75631 287 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CALCRP30988 508 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 QARSP47897 775 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLC25A1P53007 311 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KRTAP10-3P60369 221 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CDK16Q00536 496 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GBE1Q04446 702 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ARL6IP1Q15041 203 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 EIPR1Q53HC9 387 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ENPP6Q6UWR7 440 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TMEM107Q6UX40 140 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR2L13Q8N349 312 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 GPR137CQ8N3F9 429 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 OR2A12Q8NGT7 310 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ST8SIA1Q92185 356 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TSNARE1Q96NA8 513 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CCT8L2Q96SF2 557 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CHIAQ9BZP6 476 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NMUR2Q9GZQ4 415 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ANKRD19PQ9H560 264 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NIPAL2Q9H841 368 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NMRAL1Q9HBL8 299 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 NT5MQ9NPB1 228 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RSPH14Q9UHP6 348 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PEX16Q9Y5Y5 336 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PRXQ9BXM0 1461 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 ITSN2Q9NZM3 1697 aa3.39□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 STRCP1A6NGW2 1772 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CACNA1FO60840 1977 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 C9orf84Q5VXU9 1444 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 MYO3AQ8NEV4 1616 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 HCFC1P51610 2035 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LRRIQ4A6NIV6 560 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 RNF13O43567 381 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 UGT1A9O60656 530 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 CRLF1O75462 422 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SLITRK3O94933 977 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 LYPD3O95274 346 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 KRT14P02533 472 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 VDAC1P21796 283 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 SHC1P29353 583 aa3.38□□□□□ -1.87
SRP54-AS1-203ENST00000556355 IL12AP29459 219 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms