RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 RAB33BQ9H082 229 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 S100A14Q9HCY8 104 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRB-209ENST00000550857 F5H5K5 113 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 DNPH1O43598 174 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRB-209ENST00000550857 PRKCDQ05655 676 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 MFSD12Q6NUT3 480 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRB-209ENST00000550857 P2RY8Q86VZ1 359 aa7.44□□□□□ -1.22
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