RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 LAT2Q9GZY6 243 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRB-208ENST00000550358 EGLN3Q9H6Z9 239 aa7.91□□□□□ -1.14
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PTPRB-208ENST00000550358 TRAV6A0A075B6T7 132 aa7.9□□□□□ -1.14
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PTPRB-208ENST00000550358 CCDC58Q4VC31 144 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 HBMQ6B0K9 141 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 MOB3CQ70IA8 216 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 SLC22A12Q96S37 553 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRB-208ENST00000550358 DOCK1Q14185 1865 aa7.89□□□□□ -1.15
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