RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM99	Q8N816	258 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM45B	Q96B21	275 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	DUX5	Q96PT3	197 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	MKLN1	Q9UL63	735 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	EMCN	Q9ULC0	261 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		10.44	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM72	A0PK05	275 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557		G3V2L1	256 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	DNPH1	O43598	174 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	UPK3A	O75631	287 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	NCR1	O76036	304 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	PNP	P00491	289 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	FSHB	P01225	129 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	IGKV3-15	P01624	115 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	SELENOP	P49908	381 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	SERPINB9	P50453	376 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	EMB	Q6PCB8	327 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	AAED1	Q7RTV5	226 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	LRP11	Q86VZ4	500 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	OR51F2	Q8NH61	342 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM234	Q8WY98	164 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ARL8A	Q96BM9	186 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC58	Q96CX6	371 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	CCT7	Q99832	543 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	C1orf109	Q9NX04	203 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	OPN4	Q9UHM6	478 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC151	A5D8V7	595 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	AP3D1	O14617	1153 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ZSCAN12	O43309	604 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	PLPP2	O43688	288 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	RP2	O75695	350 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	AKR7A3	O95154	331 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	C6orf47	O95873	294 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	BCKDHA	P12694	445 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ALDH3B1	P43353	468 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	P2RY4	P51582	365 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	FOXL1	Q12952	345 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	LIPM	Q5VYY2	423 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	GRINA	Q7Z429	371 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	JMJD8	Q96S16	334 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	RYR3	Q15413	4870 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	C1QC	P02747	245 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	TF	P02787	698 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	CBR1	P16152	277 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	PHB	P35232	272 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	SLC35A1	P78382	337 aa		10.41	□□□□□ -0.74
BBS1-222	ENST00000533557	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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