RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 POLD4Q9HCU8 107 aa2.53□□□□□ -2
CPEB4-210ENST00000522344 EYSQ5T1H1 3165 aa2.53□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 FOCADQ5VW36 1801 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 ABCC4O15439 1325 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 RNF222A6NCQ9 220 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 GJE1A6NN92 205 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 HBQ1P09105 142 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF44P15621 663 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 CHI3L2Q15782 390 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC184Q52MB2 194 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 RABEPKQ7Z6M1 372 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 VRK2Q86Y07 508 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 OR5B2Q96R09 309 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 TBCDQ9BTW9 1192 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 CHRDL1Q9BU40 450 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 SRXN1Q9BYN0 137 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 YAE1D1Q9NRH1 226 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 MYH8P13535 1937 aa2.52□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 ASTN1O14525 1302 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 UBN2Q6ZU65 1347 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 MYH2Q9UKX2 1941 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 H3BMQ9 156 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 SNAPINO95295 136 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 MAGEA5P43359 124 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 PRPS1P60891 318 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 PAX5Q02548 391 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 AP1B1Q10567 949 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF429Q86V71 674 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF561Q8N587 486 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 RNF148Q8N7C7 305 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 MDS2Q8NDY4 140 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 GIPC3Q8TF64 312 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 SLC13A3Q8WWT9 602 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 UCN3Q969E3 161 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 VSTM2LQ96N03 204 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 MCHR1Q99705 422 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 ANO10Q9NW15 660 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 ATP6V1HQ9UI12 483 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 CYTH4Q9UIA0 394 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 AP4B1Q9Y6B7 739 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 PARP14Q460N5 1801 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 UNC80Q8N2C7 3258 aa2.51□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 DOCK1Q14185 1865 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 PLXNB2O15031 1838 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 SIPA1L1O43166 1804 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 DNAH12Q6ZR08 3092 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 A0A1W2PQ67 120 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 SSX5O60225 188 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 MT-ATP6P00846 226 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 CSF2P04141 144 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 CA3P07451 260 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 RRASP10301 218 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 COX7A1P24310 79 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 CSNK1DP48730 415 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 NDUFA9Q16795 377 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 RABGAP1LQ5R372 815 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 LIPNQ5VXI9 398 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 NEK5Q6P3R8 708 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 SNX32Q86XE0 403 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 LINC01561Q8N1V8 128 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF721Q8TF20 911 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 SLC5A11Q8WWX8 675 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 PIGCQ92535 297 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 RAB7BQ96AH8 199 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM186Q96B77 213 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 HPDLQ96IR7 371 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 CTRCQ99895 268 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 RDH8Q9NYR8 311 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 MYO9BQ13459 2157 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 CDH23Q9H251 3354 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 GBF1Q92538 1859 aa2.5□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 CLSPNQ9HAW4 1339 aa2.49□□□□□ -2.01
CPEB4-210ENST00000522344 MYH7P12883 1935 aa2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms