RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 SERPIND1P05546 499 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 GIPP09681 153 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ACP2P11117 423 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PRKAR1BP31321 381 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 MTNR1AP48039 350 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 HBA1P69905 142 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FZD5Q13467 585 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FGF11Q92914 225 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H2ACQ93077 130 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 MED8Q96G25 268 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SRMSQ9H3Y6 488 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FGF22Q9HCT0 170 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PTGFRNQ9P2B2 879 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CBLCQ9ULV8 474 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 C4orf47A7E2U8 309 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGEF33A8MVX0 844 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 K7ESM1 405 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SLC28A2O43868 658 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 TBXA2RP21731 343 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 AK4P27144 223 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 NPBWR1P48145 328 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 TSC22D1Q15714 1073 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SFXN4Q6P4A7 337 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SYT9Q86SS6 491 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CMIPQ8IY22 773 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 MEIOBQ8N635 442 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ELP5Q8TE02 316 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 OR1E3Q8WZA6 343 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 NAT6Q93015 286 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC3Q9BQI4 270 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 P2RY12Q9H244 342 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PPE3 182 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM82A0PJX8 343 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM202A6NGA9 273 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PATE3B3GLJ2 98 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ANXA5P08758 320 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF3P17036 446 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 RAP2BP61225 183 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC74AQ0VAA2 488 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SLC7A13Q8TCU3 470 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CTPS2Q9NRF8 586 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 MED11Q9P086 117 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 OR2A4O95047 310 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV4-34P06331 123 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 GDNFP39905 211 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 P2RY4P51582 365 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CDK6Q00534 326 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SLITRK4Q8IW52 837 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 OR2A7Q96R45 310 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FAIM2Q9BWQ8 316 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 KCND3Q9UK17 655 aa9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 GIPRP48546 466 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 RAB40BQ12829 278 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PDZK1IP1Q13113 114 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 NR0B2Q15466 257 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF385BQ569K4 471 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 TCTN3Q6NUS6 607 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM17Q86X19 198 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 SVBPQ8N300 66 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 STK35Q8TDR2 534 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 NR4A3Q92570 626 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 CDC6Q99741 560 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 WDR13Q9H1Z4 485 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 EGLN3Q9H6Z9 239 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 OPN4Q9UHM6 478 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-211ENST00000520276 DOCK4Q8N1I0 1966 aa9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms