RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518059.5

UBXN8-204, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN8, Length 493 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-204ENST00000518059 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.81□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 J3QLW9 94 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 CTDSP2O14595 271 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 IMPA2O14732 288 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 HCRTR2O43614 444 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 NDUFB5O43674 189 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 SLC19A2O60779 497 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ADAM11O75078 769 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ICOSLGO75144 302 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 SLC25A12O75746 678 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 NUDT14O95848 222 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 HEXBP07686 556 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 CD14P08571 375 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 OR2T7P0C7T2 308 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF19P17023 458 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 CXCR1P25024 350 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ITPKBP27987 946 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 MTNR1BP49286 362 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 SLC25A1P53007 311 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 PNLIPRP2P54317 469 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 IFITM3Q01628 133 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 DNASE1L3Q13609 305 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 CBFBQ13951 182 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 SHBQ15464 509 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 CD226Q15762 336 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF74Q16587 644 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 EMC4Q5J8M3 183 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 XKRXQ6PP77 449 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ARL9Q6T311 187 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 PRR22Q8IZ63 422 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 SYS1Q8N2H4 156 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 OR2T27Q8NH04 317 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 OR5W2Q8NH69 310 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 LIPHQ8WWY8 451 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ASB15Q8WXK1 588 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 PTP4A1Q93096 173 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ITPKCQ96DU7 683 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 C4orf36Q96KX1 117 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 LMF1Q96S06 567 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF649Q9BS31 505 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 HCAR1Q9BXC0 346 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 FKRPQ9H9S5 495 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 EML5Q05BV3 1969 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 SPTBP11277 2137 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 FABP12A6NFH5 140 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 CD8B2A6NJW9 211 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ALG1L2C9J202 215 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 MCIDASD6RGH6 385 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 OIP5O43482 229 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 LAMTOR5O43504 91 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 TSPAN2O60636 221 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 TMCC2O75069 709 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 LALBAP00709 142 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 RENP00797 406 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 CYC1P08574 325 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 GIMD1P0DJR0 217 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 CD8BP10966 210 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 MYF5P13349 255 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 TACR3P29371 465 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 SDHAP31040 664 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 DIO1P49895 249 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ERVK-25P63136 954 aa6.79□□□□□ -1.32
UBXN8-204ENST00000518059 ZNF85Q03923 595 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms