RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 SLC1A3P43003 542 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 FABP6P51161 128 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 COX20Q5RI15 118 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SPATA3Q8NHX4 192 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 HTRA1Q92743 480 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SONP18583 2426 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 FAM234BA2RU67 622 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 FAAHO00519 579 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 DBIP07108 87 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 UQCRBP14927 111 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 EPS8Q12929 822 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 GNA13Q14344 377 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SLC17A1Q14916 467 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 HMBOX1Q6NT76 420 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 SPATA19Q7Z5L4 167 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 OR10H5Q8NGA6 315 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 RLIMQ9NVW2 624 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 DCTN4Q9UJW0 460 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-211ENST00000513325 ALPK2Q86TB3 2170 aa14.83□□□□□ -0.04
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HERC3-211ENST00000513325 MAP2K6P52564 334 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A3Q00325 362 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 CEACAM7Q14002 265 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 RAB35Q15286 201 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 MAPK11Q15759 364 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ZNF544Q6NX49 715 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 HIPK1Q86Z02 1210 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ADAM19Q9H013 955 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 A0A096LNT2 108 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 AKR7A3O95154 331 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 GPIP06744 558 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 CXCR1P25024 350 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 EPHA3P29320 983 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 DSCR9P59020 149 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 TGFBR3Q03167 851 aa14.82□□□□□ -0.04
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HERC3-211ENST00000513325 HHATQ5VTY9 493 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ZNF836Q6ZNA1 936 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 VRK2Q86Y07 508 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 PEX5LQ8IYB4 626 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ZNF525Q8N782 197 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 TMEM99Q8N816 258 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ZIC4Q8N9L1 334 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 OR52P1PQ8NH57 321 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 TMEM45BQ96B21 275 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB18Q99592 522 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 RTTNQ86VV8 2226 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 CDHR4A6H8M9 788 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 LIPT2A6NK58 231 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 H7C417 338 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 RFXANKO14593 260 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 HDAC3O15379 428 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 KRT75O95678 551 aa14.81□□□□□ -0.04
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HERC3-211ENST00000513325 MPGP29372 298 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
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HERC3-211ENST00000513325 PRPS1P60891 318 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 BNIP2Q12982 314 aa14.81□□□□□ -0.04
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HERC3-211ENST00000513325 CADM2Q8N3J6 435 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 FKRPQ9H9S5 495 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 PLCE1Q9P212 2302 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 AQP7P3A6NL99 342 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-211ENST00000513325 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.8□□□□□ -0.04
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