RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa18.12■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 A0A0A6YYJ9 748 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 SLCO1B7G3V0H7 640 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 LILRA1O75019 489 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 PEX11AO75192 247 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 DAOP14920 347 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 IFFO1Q0D2I5 559 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 VHLLQ6RSH7 139 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 UGT2A3Q6UWM9 527 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 C10orf107Q8IVU9 208 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 POMGNT2Q8NAT1 580 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 ZFAND2BQ8WV99 257 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 OIT3Q8WWZ8 545 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 BOD1Q96IK1 185 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 PCDHGB4Q9UN71 923 aa18.11■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 SMIM23A6NLE4 172 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 TMEM233B4DJY2 109 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 COPEO14579 308 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 PIP5K1BO14986 540 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 FGF4P08620 206 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 KRT4P19013 534 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 PRPS1L1P21108 318 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 PCMT1P22061 227 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 PAX7P23759 505 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 SLC1A3P43003 542 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 UGT3A2Q3SY77 523 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 AAED1Q7RTV5 226 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 PMM1Q92871 262 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 TMEM45BQ96B21 275 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 DDIT4LQ96D03 193 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 APOPT1Q96IL0 206 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 SLC35G5Q96KT7 338 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 SNX18Q96RF0 628 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 DUSP26Q9BV47 211 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 TMEM45AQ9NWC5 275 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa18.1■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 KRT33AO76009 404 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 VENTXO95231 258 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 HTR3AP46098 478 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 IDH2P48735 452 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 CDH15P55291 814 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 TBRG1Q3YBR2 411 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 PAQR6Q6TCH4 344 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 RINLQ6ZS11 566 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 CLEC4FQ8N1N0 589 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 C1orf50Q9BV19 199 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 TMED7Q9Y3B3 224 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 WDR45Q9Y484 360 aa18.09■□□□□ 0.49
NELFE-210ENST00000491139 ZNF208O43345 1280 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 TRIM13O60858 407 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 AGR2O95994 175 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 GUSBP08236 651 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 IMPDH2P12268 514 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 NAAAQ02083 359 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 ATAD3BQ5T9A4 648 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 IL23RQ5VWK5 629 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 AP1ARQ63HQ0 302 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 ANKRD16Q6P6B7 361 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 RIMKLAQ8IXN7 391 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 OR4F15Q8NGB8 312 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 OR51I1Q9H343 314 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 POLE3Q9NRF9 147 aa18.08■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 VSTM5A8MXK1 200 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 CHRNGP07510 517 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 EGR1P18146 543 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 ACTG1P63261 375 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 KCNJ10P78508 379 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 PCLAFQ15004 111 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 C6orf136Q5SQH8 315 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 CROCCP2Q86T23 111 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 ZNF786Q8N393 782 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 ZIC4Q8N9L1 334 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 FNDC5Q8NAU1 212 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 OR9K2Q8NGE7 335 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 OR1K1Q8NGR3 316 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 SGMS2Q8NHU3 365 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 XAGE5Q8WWM1 108 aa18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
NELFE-210ENST00000491139 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms