RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 ATG16L1Q676U5 607 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 EPGNQ6UW88 154 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 P3H2Q8IVL5 708 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 ST8SIA1Q92185 356 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 GTF2H4Q92759 462 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 Q96MF0 132 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 BCO1Q9HAY6 547 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC52A3Q9NQ40 469 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 TIGARQ9NQ88 270 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.46□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 A0A096LPE4 126 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 A0A1W2PPZ6 126 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 AGAP5A6NIR3 686 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 GJE1A6NN92 205 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 RFXANKO14593 260 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 UBDO15205 165 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 FRS3O43559 492 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 SMPD2O60906 423 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 NDUFS7O75251 213 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 GOSR1O95249 250 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 AGR2O95994 175 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 TFPTP0C1Z6 253 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 FPR1P21462 350 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 TACR3P29371 465 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 CRATP43155 626 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC18A1P54219 525 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 EPS8Q12929 822 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 SYT14P1Q58G82 188 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 BEX5Q5H9J7 111 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 Q5PR19 223 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 C3orf33Q6P1S2 294 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 GRINAQ7Z429 371 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 CROCCP2Q86T23 111 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 COMTD1Q86VU5 262 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC43A2Q8N370 569 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM234Q8WY98 164 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 MAL2Q969L2 176 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM19Q96HH6 336 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 C18orf12Q96KH6 178 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 ZBTB18Q99592 522 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 CCL19Q99731 98 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 HHATLQ9HCP6 504 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 POLE3Q9NRF9 147 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF724A8MTY0 619 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 H7C1Q1 480 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 CLIC1O00299 241 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 CLOCKO15516 846 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF4B-208ENST00000490653 TPST1O60507 370 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms