RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 FOXN4Q96NZ1 517 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 OR51I1Q9H343 314 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 EXD2Q9NVH0 621 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 WDR45Q9Y484 360 aa8.23□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 TLDC2A0PJX2 215 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 SPAG7O75391 227 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 GUSBP08236 651 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 BMP4P12644 408 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF23P17027 643 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 SERPINB5P36952 375 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 MAGEA8P43361 318 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 PDLIM4P50479 330 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 EMX2Q04743 252 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 CHRNB3Q05901 458 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 MST1LQ2TV78 715 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 AP1ARQ63HQ0 302 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 FRRS1Q6ZNA5 592 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ANKRD46Q86W74 232 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4A15Q8NGL6 344 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 KIF18AQ8NI77 898 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 XAGE5Q8WWM1 108 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ROPN1LQ96C74 230 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF747Q9BV97 191 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 FKRPQ9H9S5 495 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 POLE3Q9NRF9 147 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ASIC5Q9NY37 505 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM181Q9P2C4 612 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 AMDHD2Q9Y303 409 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.22□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.21□□□□□ -1.09
SMARCE1-210ENST00000481231 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 AP3D1O14617 1153 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 SCN2BO60939 215 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 ALX3O95076 343 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 AGR2O95994 175 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 C1QCP02747 245 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 IMPDH2P12268 514 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 HTR3AP46098 478 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 IDH2P48735 452 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 PHC1P78364 1004 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC35A1P78382 337 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 TGFBR3Q03167 851 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC17A1Q14916 467 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 SAXO2Q658L1 398 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 OR8J2Q8NGG1 315 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 TCP10LQ8TDR4 215 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 FBXO17Q96EF6 278 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 NEURL3Q96EH8 262 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 SORCS2Q96PQ0 1159 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 PARPBPQ9NWS1 579 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 UPB1Q9UBR1 384 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 MOKQ9UQ07 419 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAPPC4Q9Y296 219 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.21□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM72A0PK05 275 aa8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 TRIM77I1YAP6 450 aa8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 NDUFS8O00217 210 aa8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 KLF11O14901 512 aa8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 BPGMP07738 259 aa8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 UQCRC2P22695 453 aa8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 TACR3P29371 465 aa8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 MPGP29372 298 aa8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 KHKP50053 298 aa8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 HILS1P60008 231 aa8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNJ10P78508 379 aa8.2□□□□□ -1.1
SMARCE1-210ENST00000481231 HPCAP84074 193 aa8.2□□□□□ -1.1
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