RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480665.1

TNS1-216, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 758 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-216ENST00000480665 TMEM99Q8N816 258 aa13.17□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 VPS33AQ96AX1 596 aa13.17□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 TMEM45BQ96B21 275 aa13.17□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 BOD1Q96IK1 185 aa13.17□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 HS6ST2Q96MM7 605 aa13.17□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 SEC61A2Q9H9S3 476 aa13.17□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 YAE1D1Q9NRH1 226 aa13.17□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 DCTN4Q9UJW0 460 aa13.17□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 LIPT2A6NK58 231 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 VWC2LB2RUY7 222 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 NPIPB7O75200 414 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 SNNO75324 88 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 PGRP06401 933 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 GKN3PP0CG01 181 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 S100A3P33764 101 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 SLC1A3P43003 542 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 BNIP2Q12982 314 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 NRF1Q16656 503 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 SWI5Q1ZZU3 235 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 DPY19L1Q2PZI1 675 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 ATAD3BQ5T9A4 648 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 AGAP6Q5VW22 663 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 SLC22A25Q6T423 547 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 PAQR6Q6TCH4 344 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 TMEM108Q6UXF1 575 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 COMTD1Q86VU5 262 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 C10orf105Q8TEF2 133 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 WDR60Q8WVS4 1066 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 ALG2Q9H553 416 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 MANSC1Q9H8J5 431 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 PCDHGB4Q9UN71 923 aa13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 CIB4A0PJX0 185 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 CDHR4A6H8M9 788 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 AQP7P3A6NL99 342 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 CCT8L1PA6NM43 557 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 TMEM229AB2RXF0 380 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 GPR171O14626 319 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 TM9SF1O15321 606 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 FRS3O43559 492 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 FZD7O75084 574 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 AKR7A3O95154 331 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 EPHA3P29320 983 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 NUDT6P53370 316 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 VLDLRP98155 873 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 HIKESHIQ53FT3 197 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 HMBOX1Q6NT76 420 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 CMIPQ8IY22 773 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 C10orf111Q8N326 155 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 CLIP4Q8N3C7 705 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 OR9K2Q8NGE7 335 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 RADILQ96JH8 1075 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 PTDSS2Q9BVG9 487 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 SEC14L4Q9UDX3 406 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 MGAT4BQ9UQ53 548 aa13.15□□□□□ -0.3
TNS1-216ENST00000480665 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 CFAP73A6NFT4 308 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 A8MV72 311 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 FTCDNL1E5RQL4 147 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 TFPTP0C1Z6 253 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 IGHV4-31P0DP07 118 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 ETFAP13804 333 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 MAGEA8P43361 318 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 SLC35A1P78382 337 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 EGR4Q05215 589 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 CEACAM7Q14002 265 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 ZNF544Q6NX49 715 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 SSX8Q7RTT4 187 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 EPHX4Q8IUS5 362 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 WDFY1Q8IWB7 410 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 C17orf78Q8N4C9 275 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 OR9I1Q8NGQ6 314 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 SORCS2Q96PQ0 1159 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 PANX1Q96RD7 426 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 FAIMQ9NVQ4 179 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa13.14□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 SLC35F4A4IF30 521 aa13.13□□□□□ -0.31
TNS1-216ENST00000480665 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms