RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 KLHL9Q9P2J3 617 aa11.52□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 CHRNA9Q9UGM1 479 aa11.52□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 OSGIN1Q9UJX0 560 aa11.52□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 TMED7Q9Y3B3 224 aa11.52□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 A0A0G2JPF8 293 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ZNF716A6NP11 495 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 NDUFAB1O14561 156 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 MRASO14807 208 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SMPD2O60906 423 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 BCHEP06276 602 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 IGHV1-2P23083 117 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 IL32P24001 234 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 RBBP4Q09028 425 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.575e-6■■■■□ 19.6
HPS1-211ENST00000478087 BNIP2Q12982 314 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ITGADQ13349 1161 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 GCNT6Q5T4J0 391 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ZNF836Q6ZNA1 936 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SNX32Q86XE0 403 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 PEX5LQ8IYB4 626 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 C10orf111Q8N326 155 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 STEAP2Q8NFT2 490 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 OR8J3Q8NGG0 315 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 BBS10Q8TAM1 723 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 IGFBPL1Q8WX77 278 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 MAL2Q969L2 176 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 TMEM204Q9BSN7 226 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 MYLK2Q9H1R3 596 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 TMEM38AQ9H6F2 299 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ABCA2Q9BZC7 2435 aa11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 DPRXA6NFQ7 191 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 CFAP73A6NFT4 308 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ZNF724A8MTY0 619 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 C5orf58C9J3I9 102 aa11.5□□□□□ -0.57
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HPS1-211ENST00000478087 FPR1P21462 350 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 HOXC5Q00444 222 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 EPS8Q12929 822 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 Q5PR19 223 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 FAM91A1Q658Y4 838 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 REP15Q6BDI9 236 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 Q6ZT83 130 aa11.5□□□□□ -0.57
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HPS1-211ENST00000478087 RETREG3Q86VR2 466 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 P3H2Q8IVL5 708 aa11.5□□□□□ -0.57
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HPS1-211ENST00000478087 ZNF100Q8IYN0 542 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 OR52P1PQ8NH57 321 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 PIGTQ969N2 578 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 LRRC58Q96CX6 371 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 TMEM19Q96HH6 336 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 LRRC37BQ96QE4 947 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 HDHD5Q9BXW7 423 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ADAM19Q9H013 955 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 OR10A4Q9H209 315 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 EVA1AQ9H8M9 152 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 EFCAB1Q9HAE3 211 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 BCL2L10Q9HD36 194 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 IFT52Q9Y366 437 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 DSPPQ9NZW4 1301 aa11.5□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 LOC100653049A0A140TA62 436 aa11.49□□□□□ -0.57
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HPS1-211ENST00000478087 CDHR4A6H8M9 788 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 FBP2O00757 339 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 CLOCKO15516 846 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 FRS3O43559 492 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 KRT34O76011 436 aa11.49□□□□□ -0.57
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HPS1-211ENST00000478087 ARAFP10398 606 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 ETS2P15036 469 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 SLC1A3P43003 542 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 H3F3AP84243 136 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 P2RY6Q15077 328 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 STK11Q15831 433 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 LIN52Q52LA3 116 aa11.49□□□□□ -0.57
HPS1-211ENST00000478087 NCMAPQ5T1S8 102 aa11.49□□□□□ -0.57
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