RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 OR52R1Q8NGF1 315 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 PHF21AQ96BD5 680 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 DERL3Q96Q80 235 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 GFI1Q99684 422 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 LIN7BQ9HAP6 207 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 INPP5EQ9NRR6 644 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 HAO2Q9NYQ3 351 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 COQ3Q9NZJ6 369 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 CHRNA9Q9UGM1 479 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 CFAP54Q96N23 3096 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 PSMD9O00233 223 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 FOXS1O43638 330 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 TSC22D2O75157 780 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 WNT1P04628 370 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 ICAM2P13598 275 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 S1PR1P21453 382 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 NRG3P56975 720 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 NFATC4Q14934 902 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 ALG10BQ5I7T1 473 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM255AQ5JRV8 349 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 PYHIN1Q6K0P9 492 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF613Q6PF04 617 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 KIRREL2Q6UWL6 708 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 CREB3L2Q70SY1 520 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 ABHD13Q7L211 337 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 YAF2Q8IY57 180 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 CA13Q8N1Q1 262 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 LHFPL5Q8TAF8 219 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 UQCC2Q9BRT2 126 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 GSDMCQ9BYG8 508 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 LYRM4Q9HD34 91 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 C2orf42Q9NWW7 574 aa10.06□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 PIN1P1O15428 100 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 SELENOFO60613 162 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 MT-ND4P03905 459 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 CD53P19397 219 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 PSMB10P40306 273 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 GDI2P50395 445 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 CDK5R1Q15078 307 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 NNATQ16517 81 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 DEFB110Q30KQ9 67 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 LINC00114Q6XXX2 140 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 CDK20Q8IZL9 346 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 CAMKVQ8NCB2 501 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 SLC22A18Q96BI1 424 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 SMIM19Q96E16 107 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 HYLS1Q96M11 299 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 BEX1Q9HBH7 125 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 FAM60AQ9NP50 221 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 GLTPQ9NZD2 209 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 SERTAD3Q9UJW9 196 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 ICAM5Q9UMF0 924 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM5Q9Y2B1 443 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 OGG1O15527 345 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 RDH16O75452 317 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 NKX2-2O95096 273 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 PDGFAP04085 211 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 NTSR1P30989 418 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 KIAA1024LP59773 190 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 ST3GAL2Q16842 350 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 ALG11Q2TAA5 492 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 RTL4Q6ZR62 310 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 TOMM5Q8N4H5 51 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 LGALS14Q8TCE9 139 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 WDR92Q96MX6 357 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 NMNAT3Q96T66 252 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 GABRG3Q99928 467 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 MED28Q9H204 178 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM27Q9HBJ8 222 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 BRD7Q9NPI1 651 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 OR6C68A6NDL8 312 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 UBL3O95164 117 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 MMP15P51511 669 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 LBX1P52954 281 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf3-214ENST00000473778 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms