RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	KIF18B	Q86Y91	864 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CYGB	Q8WWM9	190 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TAAR8	Q969N4	342 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	C5orf34	Q96MH7	638 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	APOL4	Q9BPW4	351 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	FANCF	Q9NPI8	374 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		11.52	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ENO4	A6NNW6	628 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	BCKDK	O14874	412 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PIP5K1C	O60331	668 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	WISP1	O95388	367 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	BGLAP	P02818	100 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	HMGN1	P05114	100 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	GNAO1	P09471	354 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	HK1	P19367	917 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SMS	P52788	366 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	NUP107	P57740	925 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	FXYD6P3	P58550	94 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	RAC1	P63000	192 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CSNK2B	P67870	215 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	LTB	Q06643	244 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	FOXF1	Q12946	379 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PDK3	Q15120	406 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF766	Q5HY98	468 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	C12orf73	Q69YU5	71 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	BORA	Q6PGQ7	559 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	OAF	Q86UD1	273 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SCAI	Q8N9R8	606 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF217	Q8TC41	542 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	DDIT4L	Q96D03	193 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	NANS	Q9NR45	359 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		11.51	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0G2JMM0	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PPB8	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PRS3	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	PINLYP	A6NC86	204 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	GJE1	A6NN92	205 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	IMPA2	O14732	288 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ARPC3	O15145	178 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	DNPH1	O43598	174 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	IDH3B	O43837	385 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CH25H	O95992	272 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	BMP7	P18075	431 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR4	P46093	362 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CDC42	P60953	191 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	IL1RL1	Q01638	556 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ZP4	Q12836	540 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	RAPSN	Q13702	412 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	GINS1	Q14691	196 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	LNX2	Q8N448	690 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TEX12	Q9BXU0	123 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	OR52D1	Q9H346	318 aa		11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
TRAF4-208	ENST00000469529	VDAC3	Q9Y277	283 aa		11.5	□□□□□ -0.57

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