RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465309.6

LMO7-208, Transcript of LIM domain 7, humanhuman

TSL 3

Gene LMO7, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7-208ENST00000465309 SYT5O00445 386 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 TFECO14948 347 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 SLC22A1O15245 554 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 RGS10O43665 173 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 TCF21O43680 179 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 PLOD3O60568 738 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 MITFO75030 526 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 SERPINB7O75635 380 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 CCNB2O95067 398 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 VENTXO95231 258 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 NSA2O95478 260 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 ATP1B1P05026 303 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 IFI6P09912 130 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 ACP2P11117 423 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 PORP16435 677 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 IL7RP16871 459 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 RHCEP18577 417 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 EPHA2P29317 976 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 IFNA8P32881 189 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 KRT20P35900 424 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 PIGAP37287 484 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 YAP1P46937 504 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 KHKP50053 298 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 PRKAG1P54619 331 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 ATP5J2P56134 94 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 ISL1P61371 349 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 HPCAP84074 193 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 NPRL3Q12980 569 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 MEP1AQ16819 746 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 SYT16Q17RD7 645 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 RNFT1Q5M7Z0 435 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 MFSD12Q6NUT3 480 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 CDC73Q6P1J9 531 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 FAHD1Q6P587 224 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 GALNT5Q7Z7M9 940 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 LACC1Q8IV20 430 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 LINC00471Q8N535 108 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 SMYD1Q8NB12 490 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 SLC16A11Q8NCK7 471 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 ZNF540Q8NDQ6 660 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 OR10G2Q8NGC3 310 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 OR5M9Q8NGP3 310 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 ZNF675Q8TD23 568 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 PROX1Q92786 737 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 TANKQ92844 425 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 BORCS5Q969J3 196 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 MUL1Q969V5 352 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 TMIGD2Q96BF3 282 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 COG8Q96MW5 612 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 PSD2Q9BQI7 771 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 FUZQ9BT04 418 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 ACTRT3Q9BYD9 372 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 SLC38A1Q9H2H9 487 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 PALMDQ9NP74 551 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 MAT2BQ9NZL9 334 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 P2RX2Q9UBL9 471 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 TRPC4Q9UBN4 977 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 ACAD8Q9UKU7 415 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 TMCC3Q9ULS5 477 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 CDC14AQ9UNH5 594 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 PLCL2Q9UPR0 1127 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 ENPP4Q9Y6X5 453 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 DSPPQ9NZW4 1301 aa5.95□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 A0A0G2JPF8 293 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 OR2W5A6NFC9 320 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 PTGES3LE9PB15 166 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 TMPRSS2O15393 492 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 FCMRO60667 390 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 TPST2O60704 377 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 CTNSO60931 367 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 OR2B3O76000 313 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 SOX30O94993 753 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 GADD45GO95257 159 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 CBX7O95931 251 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 LGI1O95970 557 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 SERPINA7P05543 415 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 SLC35E2P0CK97 266 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 NR2F1P10589 423 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 ALAS2P22557 587 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 GGT2P36268 569 aa5.94□□□□□ -1.46
LMO7-208ENST00000465309 ADH7P40394 386 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms