RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 C12orf10Q9HB07 376 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 GP6Q9HCN6 339 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 PARPBPQ9NWS1 579 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 CMTM6Q9NX76 183 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 MED12LQ86YW9 2145 aa8.56□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 C16orf97H3BN30 126 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 FMO6PO60774 539 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 IFNW1P05000 195 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 CALB2P22676 271 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 SSTR2P30874 369 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 GSK3BP49841 420 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 SELENOWP63302 87 aa8.55□□□□□ -1.04
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PKP4-208ENST00000462335 CDSNQ15517 529 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 ZNF787Q6DD87 383 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 GLYATQ6IB77 296 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 VWA1Q6PCB0 445 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 ZNF613Q6PF04 617 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 GDF7Q7Z4P5 450 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 TUSC5Q8IXB3 177 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 CDK20Q8IZL9 346 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 DEFB107AQ8IZN7 70 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 PGAM4Q8N0Y7 254 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 RNF128Q8TEB7 428 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 MCUR1Q96AQ8 359 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 C3orf49Q96BT1 292 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 TAMM41Q96BW9 452 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 STARD4Q96DR4 205 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 ADGRG7Q96K78 797 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 ARL5BQ96KC2 179 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 FNDC11Q9BVV2 318 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 PRR14Q9BWN1 585 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 MCCC2Q9HCC0 563 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 UPB1Q9UBR1 384 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 EDARQ9UNE0 448 aa8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
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PKP4-208ENST00000462335 A8MXE2 369 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 NME4O00746 187 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 TPST2O60704 377 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 CYTIPO60759 359 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 ADAM11O75078 769 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 TNFSF13O75888 250 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 AKR7A3O95154 331 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 VAMP5O95183 116 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 SERPINA1P01009 418 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 CD8BP10966 210 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 UMPSP11172 480 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 CBLP22681 906 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 IL32P24001 234 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 AGTR1P30556 359 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 CD79BP40259 229 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 OR1E2P47887 323 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 GZMMP51124 257 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 CDH12P55289 794 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 DLX5P56178 289 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 SLC25A3Q00325 362 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 NPTX1Q15818 432 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 IFI44LQ53G44 452 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 PAQR6Q6TCH4 344 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 TMEM200AQ86VY9 491 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 FITM2Q8N6M3 262 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 RNF148Q8N7C7 305 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 MFSD8Q8NHS3 518 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 MPP4Q96JB8 637 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 LRGUKQ96M69 825 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 ARHGDIGQ99819 225 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 MED18Q9BUE0 208 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 HDHD5Q9BXW7 423 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.54□□□□□ -1.04
PKP4-208ENST00000462335 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa8.54□□□□□ -1.04
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