RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 HRGP04196 525 aa6.21□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 CD247P20963 164 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 FPR1P21462 350 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 CBLP22681 906 aa6.21□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.21□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.2□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRN3E7EW58 273 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF208O43345 1280 aa6.2□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
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RABGEF1-206ENST00000461017 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RABGEF1-206ENST00000461017 USF3Q68DE3 2245 aa6.19□□□□□ -1.42
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