RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 BPIFA2Q96DR5 249 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SGTBQ96EQ0 304 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CAPZA3Q96KX2 299 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PPP3R2Q96LZ3 170 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 C12orf66Q96MD2 445 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 FOPNLQ96NB1 174 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 DEFB118Q96PH6 123 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ACCSQ96QU6 501 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PFDN5Q99471 154 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 RTP3Q9BQQ7 232 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ACBD6Q9BR61 282 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CHRDL1Q9BU40 450 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MROQ9BYG7 248 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TRIM9Q9C026 710 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 WWP1Q9H0M0 922 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 LRRN3Q9H3W5 708 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ARMC7Q9H6L4 198 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 GAREM1Q9H706 876 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 AUNIPQ9H7T9 357 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 FKRPQ9H9S5 495 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ELOVL3Q9HB03 270 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 FOLH1BQ9HBA9 442 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM30AQ9NV96 361 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ASB6Q9NWX5 421 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 GLTPQ9NZD2 209 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MAT2BQ9NZL9 334 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CD274Q9NZQ7 290 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MIOXQ9UGB7 285 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MLXQ9UH92 298 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CLEC2DQ9UHP7 191 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 BTNL2Q9UIR0 455 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 C3orf18Q9UK00 162 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF221Q9UK13 617 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MGAT4AQ9UM21 535 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ABCG2Q9UNQ0 655 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ERVW-1Q9UQF0 538 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 LRP12Q9Y561 859 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ALG5Q9Y673 324 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PCSK5Q92824 1860 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 NALCNQ8IZF0 1738 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SHANK3Q9BYB0 1731 aa3.05□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 GCC2Q8IWJ2 1684 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 C1orf167Q5SNV9 1468 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZFYVE9O95405 1425 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PTPRUQ92729 1446 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CARMIL3Q8ND23 1372 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A1B0GV90 55 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A1W2PNV4 684 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A1W2PPC1 479 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 METTL21EPA6NDL7 271 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SERINC4A6NH21 518 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 METTL15A6NJ78 407 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 LINC01548A6NM66 108 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CENPXA8MT69 81 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 E7ESA3 106 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 NPIPA7E9PJI5 369 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 M0QZK8 103 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 KCNK1O00180 336 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CDC7O00311 574 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MGST3O14880 152 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 KLF11O14901 512 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 COCHO43405 550 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 KCNAB3O43448 404 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SPRY3O43610 288 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 OR1F1O43749 312 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 BCAR3O75815 825 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TM7SF2O76062 418 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 DFFBO76075 338 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SRP72O76094 671 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 STK17BO94768 372 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TNFAIP8O95379 198 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 NADKO95544 446 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ANGPTL1O95841 491 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 GOT2P00505 430 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PGK1P00558 417 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 OAS1P00973 400 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 VTNP04004 478 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CRYGCP07315 174 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 NPIPA8P0DM63 369 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 IFI30P13284 250 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CBR1P16152 277 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CA6P23280 308 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 DTYMKP23919 212 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 IGFBP5P24593 272 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 LAP3P28838 519 aa3.04□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 HSD11B1P28845 292 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms