RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR31Q8NA23 367 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR60Q8WVS4 1066 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 HTRA1Q92743 480 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 DDIT4LQ96D03 193 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 MUS81Q96NY9 551 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 ZBTB18Q99592 522 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 PARD6BQ9BYG5 372 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 RLIMQ9NVW2 624 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 PARPBPQ9NWS1 579 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 UPB1Q9UBR1 384 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP23Q9Y6H3 246 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CR1P17927 2039 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM234BA2RU67 622 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 PDLIM1O00151 329 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF208O43345 1280 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CD5LO43866 347 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 GPRIN2O60269 458 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 DBIP07108 87 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 GKN3PP0CG01 181 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 UQCRBP14927 111 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 EPHA3P29320 983 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 FABP6P51161 128 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 NUDT6P53370 316 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC25A3Q00325 362 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 EPS8Q12929 822 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CEACAM7Q14002 265 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TSPO2Q5TGU0 170 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SPATA19Q7Z5L4 167 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 MUC15Q8N387 334 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 PMM1Q92871 262 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 RHNO1Q9BSD3 238 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC7A10Q9NS82 523 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CBLN4Q9NTU7 201 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP9.04□□□□□ -0.969e-15■■□□□ 12.4
SH3BP4-206ENST00000446904 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 LIPT2A6NK58 231 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 FAAHO00519 579 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 AKR7A3O95154 331 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 KRT75O95678 551 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 KITP10721 976 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CXCR1P25024 350 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TGFBR3Q03167 851 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 BNIP2Q12982 314 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC17A1Q14916 467 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB35Q15286 201 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 OR7A5Q15622 319 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 MAPK11Q15759 364 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 NXNQ6DKJ4 435 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 HMBOX1Q6NT76 420 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 PAQR6Q6TCH4 344 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CLEC2AQ6UVW9 174 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF836Q6ZNA1 936 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 AAED1Q7RTV5 226 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 VRK2Q86Y07 508 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 PEX5LQ8IYB4 626 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 CADM2Q8N3J6 435 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM99Q8N816 258 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 ZIC4Q8N9L1 334 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 OR9K2Q8NGE7 335 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 MGARPQ8TDB4 240 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 ADAM19Q9H013 955 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC17A5Q9NRA2 495 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC6A13Q9NSD5 602 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 AMDHD2Q9Y303 409 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.96
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A096LNT2 108 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 CDHR4A6H8M9 788 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 TRPC5OSA6NMA1 111 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 A8MV72 311 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 RFXANKO14593 260 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 KLF11O14901 512 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 HDAC3O15379 428 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 GPIP06744 558 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-206ENST00000446904 PRG2P13727 222 aa9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms