RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446903.5

TNS1-210, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS1, Length 2,464 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-210ENST00000446903 TFECO14948 347 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 TO15178 435 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 IDH3BO43837 385 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 TRAPPC2P0DI81 140 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 TRAPPC2BP0DI82 140 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 CELP19835 753 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 ATP6V1E1P36543 226 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 DDOSTP39656 456 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 GPR143P51810 404 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 DCAF7P61962 342 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 ACY1Q03154 408 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 CBLN3Q6UW01 205 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 RABEPKQ7Z6M1 372 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 OAFQ86UD1 273 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 SIRT6Q8N6T7 355 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 ZNF441Q8N8Z8 693 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 OR1N1Q8NGS0 311 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 OR2I1PQ8NGU4 316 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 PTP4A1Q93096 173 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 GAL3ST4Q96RP7 486 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 WWTR1Q9GZV5 400 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 LRRN3Q9H3W5 708 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 COMMD3Q9UBI1 195 aa12.65□□□□□ -0.38
TNS1-210ENST00000446903 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 RGS13O14921 159 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 TSPAN2O60636 221 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 PPP1R3DO95685 299 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 UBL4AP11441 157 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 MST1P26927 711 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 CAV3P56539 151 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 SIGLEC14Q08ET2 396 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 GID4Q8IVV7 300 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 EID2Q8N6I1 236 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 ZNF527Q8NB42 609 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 NEIL3Q8TAT5 605 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 ST6GAL2Q96JF0 529 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 ART5Q96L15 291 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 OR6C1Q96RD1 312 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 SNX18Q96RF0 628 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 ADOQ96SZ5 270 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 TMED9Q9BVK6 235 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 MMP28Q9H239 520 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 POLHQ9Y253 713 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 HMX3A6NHT5 357 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 GABRPO00591 440 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 SCDO00767 359 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 ICOSLGO75144 302 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 B3GLCTQ6Y288 498 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 MARCH9Q86YJ5 346 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 RDH10Q8IZV5 341 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 SLC43A2Q8N370 569 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 STT3BQ8TCJ2 826 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 SGTBQ96EQ0 304 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 CCDC74BQ96LY2 380 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 HDHD5Q9BXW7 423 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 ASB6Q9NWX5 421 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 BAIAP2Q9UQB8 552 aa12.64□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 MPDZO75970 2070 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 CDC14CA4D256 554 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 FAM86C2PA6NEL3 165 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 PATE3B3GLJ2 98 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 LRRN3E7EW58 273 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 CFIP05156 583 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 SLC2A5P22732 501 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 LCN1P31025 176 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 RCVRNP35243 200 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 ZFP69Q49AA0 526 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 LCN1P1Q5VSP4 162 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 FCRLBQ6BAA4 426 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 RTL4Q6ZR62 310 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 LRRC17Q8N6Y2 441 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 DEPDC7Q96QD5 511 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 MESP1Q9BRJ9 268 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 CENPXA8MT69 81 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 AGRPO00253 132 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 YKT6O15498 198 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 ZNF264O43296 627 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 CFL1P23528 166 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 NOS3P29474 1203 aa12.63□□□□□ -0.39
TNS1-210ENST00000446903 SLC6A6P31641 620 aa12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms