RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 KIF17Q9P2E2 1029 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 TRPC4Q9UBN4 977 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 PCTPQ9UKL6 214 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 MGAT4AQ9UM21 535 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 SSR3Q9UNL2 185 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 LIPT1Q9Y234 373 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 KCNK7Q9Y2U2 307 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC6-210ENST00000441703 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
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HDAC6-210ENST00000441703 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 CIB4A0PJX0 185 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 PQLC2LA1A4F0 135 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 C7orf66A4D0T2 115 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC6-210ENST00000441703 NEURL1O76050 574 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC6-210ENST00000441703 EPOP01588 193 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 STATHP02808 62 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ESR1P03372 595 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 C8orf89P0DMQ9 161 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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HDAC6-210ENST00000441703 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 CCT3P49368 545 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 MAN2A2P49641 1150 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 MAP2K6P52564 334 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC6-210ENST00000441703 GPR85P60893 370 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 HOXC5Q00444 222 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC6-210ENST00000441703 ACVR1Q04771 509 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC6-210ENST00000441703 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 BTN1A1Q13410 526 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 TP53BP2Q13625 1128 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 KLHL22Q53GT1 634 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 EMC4Q5J8M3 183 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC6-210ENST00000441703 C1orf185Q5T7R7 199 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 DDI2Q5TDH0 399 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC6-210ENST00000441703 C12orf54Q6X4T0 127 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC6-210ENST00000441703 LAX1Q8IWV1 398 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 FAM9CQ8IZT9 166 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 LGI4Q8N135 537 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 UXS1Q8NBZ7 420 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 IPMKQ8NFU5 416 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 OR4A15Q8NGL6 344 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 OR5K2Q8NHB8 316 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SPATA22Q8NHS9 363 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM163Q8TC26 289 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ROBO4Q8WZ75 1007 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 UCN3Q969E3 161 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 IMMP1LQ96LU5 166 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 FOPNLQ96NB1 174 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 OR2M2Q96R28 347 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 COPS8Q99627 209 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM43Q9BTV4 400 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF416Q9BWM5 594 aa5.89□□□□□ -1.47
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HDAC6-210ENST00000441703 DPY30Q9C005 99 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 DEFB127Q9H1M4 99 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 MED28Q9H204 178 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ASB8Q9H765 288 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ANKRA2Q9H9E1 313 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 UBTD1Q9HAC8 227 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 FANCFQ9NPI8 374 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 MCUBQ9NWR8 336 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 CLN6Q9NWW5 311 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 ALKBH4Q9NXW9 302 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC6-210ENST00000441703 UBP1Q9NZI7 540 aa5.89□□□□□ -1.47
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