RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	GGT1	P19440	569 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CCNA2	P20248	432 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2B6	P58173	313 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC35A1	P78382	337 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	BSPH1	Q075Z2	132 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	DMTN	Q08495	405 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PPA1	Q15181	289 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF220	Q5VTB9	566 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXW5	Q969U6	566 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	APH1A	Q96BI3	265 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM19	Q96HH6	336 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		15.63	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5H1	A6NKK0	313 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF223	E7ERA6	249 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PDLIM1	O00151	329 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CLOCK	O15516	846 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TGDS	O95455	350 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	GKN3P	P0CG01	181 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	BMP2	P12643	396 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC17A1	Q14916	467 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PAQR6	Q6TCH4	344 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	NEUROG1	Q92886	237 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM2	Q9C040	744 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		15.62	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PLCE1	Q9P212	2302 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0G2JPF8	293 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	IFNA2	P01563	188 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	IGHV3-9	P01782	118 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SOD3	P08294	240 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RGN	Q15493	299 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	STK11	Q15831	433 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	MUCL1	Q96DR8	90 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	EBF4	Q9BQW3	602 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	REG4	Q9BYZ8	158 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ASB6	Q9NWX5	421 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		15.61	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	LIPT2	A6NK58	231 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SHISA9	B4DS77	424 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CLIC1	O00299	241 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ITGA5	P08648	1049 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	NUDT7	P0C024	238 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	IDUA	P35475	653 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	IDH3A	P50213	366 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	FADD	Q13158	208 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	VEZF1	Q14119	521 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ETFDH	Q16134	617 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PGGHG	Q32M88	737 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PHC2	Q8IXK0	858 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	MUS81	Q96NY9	551 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	IFT52	Q9Y366	437 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	GMEB1	Q9Y692	573 aa		15.6	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A096LPI6	279 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	NPIPB7	O75200	414 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RAD51D	O75771	328 aa		15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	GPI	P06744	558 aa		15.59	■□□□□ 0.09

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