RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 NCDNQ9UBB6 729 aa15.5■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF281Q9Y2X9 895 aa15.5■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 NUP210LQ5VU65 1888 aa15.5■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 COL6A3P12111 3177 aa15.5■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1W2PP55 124 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1W2PQU0 124 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1W2PRG6 482 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 OR6C65A6NJZ3 312 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 ACOT7O00154 380 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 PEX12O00623 359 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 IMPA2O14732 288 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 TSC22D2O75157 780 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 TACSTD2P09758 323 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 GKN3PP0CG01 181 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 CXCL3P19876 107 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 TNFRSF4P43489 277 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 SRP9P49458 86 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 SLC25A1P53007 311 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 PRPS1P60891 318 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 DNM1P46Q6ZS02 220 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 TIGD4Q8IY51 512 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 OR4E2Q8NGC2 313 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 SFXN1Q9H9B4 322 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 HRASLSQ9HDD0 168 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 TAS2R5Q9NYW4 299 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 MOKQ9UQ07 419 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 TRAV27A0A087WT01 109 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 M0R233 179 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 CYR61O00622 381 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 RGS11O94810 467 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 APBB3O95704 486 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 TFP02787 698 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 SRMP19623 302 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 EDNRAP25101 427 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 FAUP35544 74 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF81P51508 661 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 PUDPQ08623 228 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 FGFBP1Q14512 234 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 TCEA2Q15560 299 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 ALG10BQ5I7T1 473 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 FIGLAQ6QHK4 219 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 RNF44Q7L0R7 432 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 NUP54Q7Z3B4 507 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 CMTM4Q8IZR5 234 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 OR4N4Q8N0Y3 316 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 OR51A7Q8NH64 312 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 PEX11GQ96HA9 241 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 NECTIN4Q96NY8 510 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 TAS2R8Q9NYW2 309 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 FLRT3Q9NZU0 649 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 POMT2Q9UKY4 750 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF337Q9Y3M9 751 aa15.49■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 LAMA3Q16787 3333 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC72A6NJI9 287 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 WNT1P04628 370 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 FCARP24071 287 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 DPP4P27487 766 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 GABRA3P34903 492 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 RAB38P57729 211 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 CLDN2P57739 230 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 CAMK1Q14012 370 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 NFATC4Q14934 902 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 TP53I3Q53FA7 332 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 C2orf27AQ580R0 203 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 SFTPA1Q8IWL2 248 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF687Q8N1G0 1237 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 OR11G2Q8NGC1 345 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 OR2T35Q8NGX2 323 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 LIPHQ8WWY8 451 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 FGF13Q92913 245 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 DDOQ99489 341 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 G6PC3Q9BUM1 346 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 LMAN2LQ9H0V9 348 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 FGF22Q9HCT0 170 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 V9GY05 133 aa15.48■□□□□ 0.07
HCLS1-202ENST00000428394 NPIPB9F8W1W9 429 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms