RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 IL32P24001 234 aa22.39■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 STAT5AP42229 794 aa22.39■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 PPICP45877 212 aa22.39■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 MAP2K3P46734 347 aa22.39■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 IDH2P48735 452 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 OR10G2Q8NGC3 310 aa22.39■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 SEMA4CQ9C0C4 833 aa22.39■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 WWTR1Q9GZV5 400 aa22.39■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 Q9N2J8 555 aa22.39■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 ALG5Q9Y673 324 aa22.39■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 PEX12O00623 359 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 STX11O75558 287 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 RAB40ALP0C0E4 278 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 CRYBB2P43320 205 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 KCNJ5P48544 419 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 CDC42P60953 191 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 MAPK14Q16539 360 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 KIRREL2Q6UWL6 708 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 SPPL2AQ8TCT8 520 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 SLC25A46Q96AG3 418 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 CBLCQ9ULV8 474 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 OR10H1Q9Y4A9 318 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 CHST2Q9Y4C5 530 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 HSPB11Q9Y547 144 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 TERTO14746 1132 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 SLC43A1O75387 559 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 TALDO1P37837 337 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 SLC26A5P58743 744 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 MEDAGQ5VYS4 303 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 RNLSQ5VYX0 342 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 BCORP1Q8N888 145 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 HDHD5Q9BXW7 423 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 SAP130Q9H0E3 1048 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 ASCL3Q9NQ33 180 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 CLN6Q9NWW5 311 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 CDRT15L2A8MXV6 281 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 STMND1H3BQB6 276 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 MYL12BO14950 172 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 SLC22A5O76082 557 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 COX6A1P12074 109 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 MYL12AP19105 171 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 DLSTP36957 453 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 BAMBIQ13145 260 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 IFI44LQ53G44 452 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 PRR22Q8IZ63 422 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 SLC5A8Q8N695 610 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 OR4D11Q8NGI4 311 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 OR4C15Q8NGM1 316 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 LHFPL5Q8TAF8 219 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 GPR137Q96N19 417 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 MIXL1Q9H2W2 232 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 LIN7BQ9HAP6 207 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 SNTG1Q9NSN8 517 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 RABL2BQ9UNT1 228 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 TRIM77I1YAP6 450 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 MASP2O00187 686 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 SOCS6O14544 535 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 AK1P00568 194 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 CELA2AP08217 269 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 MMP11P24347 488 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 CLDN20P56880 219 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 RNF4P78317 190 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 ZNF619Q8N2I2 560 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 OR4M2Q8NGB6 313 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 OR52P1PQ8NH57 321 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 PRRG3Q9BZD7 231 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 KCNN2Q9H2S1 579 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 ABCB9Q9NP78 766 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 SSR3Q9UNL2 185 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 ZNF311Q5JNZ3 666 aa22.36■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 PAMR1Q6UXH9 720 aa22.36■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 SLC29A4Q7RTT9 530 aa22.36■■□□□ 1.17
CTU1-201ENST00000421832 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms