RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 SRP54P61011 504 aaKnown RBP-1.83□□□□□ -2.7
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ARG2P78540 354 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 TGFBR3Q03167 851 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSPB3Q12988 150 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 GUCA2BQ16661 112 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMU1Q2TAY7 513 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLBD1Q6P4A8 553 aa-1.83□□□□□ -2.7
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CHST3Q7LGC8 479 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR142Q7Z601 462 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 ITIH5Q86UX2 942 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERPINA9Q86WD7 417 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 PEX5LQ8IYB4 626 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 P2RX5Q93086 422 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 LHX4Q969G2 390 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM46BQ96A09 425 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR52B2Q96RD2 323 aa-1.83□□□□□ -2.7
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RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB127Q9H1M4 99 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 C16orf95Q9H693 158 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC25A19Q9HC21 320 aa-1.83□□□□□ -2.7
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP39A1Q9NYL5 469 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 TREM2Q9NZC2 230 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL37Q9NZH6 218 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 LHX3Q9UBR4 397 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTSFQ9UBX1 484 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIF25Q9UIL4 384 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP-1.83□□□□□ -2.7
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RNU6-172P-201ENST00000411000 EPG5Q9HCE0 2579 aa-1.83□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLIT2O94813 1529 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM150CB9EJG8 249 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 E9PSI1 815 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 H0YJW9 148 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC22A1O15245 554 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 TM9SF1O15321 606 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC31A2O15432 143 aa-1.84□□□□□ -2.7
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CNR1P21554 472 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 ICAM3P32942 547 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYB561P49447 251 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP-1.84□□□□□ -2.7
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RNU6-172P-201ENST00000411000 DLX1P56177 255 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLP1P60201 277 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPP38P78345 283 aaKnown RBP-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDK5R1Q15078 307 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 SGCAQ16586 387 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFA9Q16795 377 aa-1.84□□□□□ -2.7
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TEX44Q53QW1 395 aa-1.84□□□□□ -2.7
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RNU6-172P-201ENST00000411000 DDI2Q5TDH0 399 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa-1.84□□□□□ -2.7
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CLEC17AQ6ZS10 378 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGAP1Q75T13 922 aa-1.84□□□□□ -2.7
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF595Q8IYB9 648 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP-1.84□□□□□ -2.7
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC2A14Q8TDB8 520 aa-1.84□□□□□ -2.7
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RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP-1.84□□□□□ -2.7
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ECSITQ9BQ95 431 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF665Q9H7R5 613 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTPS2Q9NRF8 586 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 C21orf62Q9NYP8 219 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLLPQ9Y342 182 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM131Q92545 1883 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa-1.84□□□□□ -2.7
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA1671Q9BY89 1806 aa-1.84□□□□□ -2.7
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