RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 XAGE5Q8WWM1 108 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 NCSTNQ92542 709 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 KAT2AQ92830 837 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 SLC35B4Q969S0 331 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 RAX2Q96IS3 184 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 DGAT2Q96PD7 388 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ZNF556Q9HAH1 456 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 VCX3AQ9NNX9 186 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ADAP2Q9NPF8 381 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 EQTNQ9NQ60 294 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 C14orf105Q9NVL8 296 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 FAM118AQ9NWS6 357 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 NDUFA13Q9P0J0 144 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 HCN3Q9P1Z3 774 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 IFT52Q9Y366 437 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 SH3GLB1Q9Y371 365 aa5.99□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 NUP210LQ5VU65 1888 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ZGRF1Q86YA3 2104 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 E9PQ18 207 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 MKRN2OSH3BPM6 223 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 FMO6PO60774 539 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 LDB3O75112 727 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 STX11O75558 287 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 DIRAS1O95057 198 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 NKX2-2O95096 273 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CPNE6O95741 557 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 LGI1O95970 557 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 DBIP07108 87 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 H1F0P07305 194 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CYC1P08574 325 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CCDC159P0C7I6 412 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ACP2P11117 423 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 TNFRSF1BP20333 461 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CBLP22681 906 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 F8A1P23610 371 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CTSSP25774 331 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CD1CP29017 333 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 MAP3K8P41279 467 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 OR1E2P47887 323 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 HLCSP50747 726 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 DAPP51397 102 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 UGT2B15P54855 530 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CXCR4P61073 352 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 MGAT2Q10469 447 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 STX4Q12846 297 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 SLC13A2Q13183 592 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 DUSP5Q16690 384 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 DUSP7Q16829 419 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 DCST2Q5T1A1 773 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 MLIPQ5VWP3 458 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 NKAIN2Q5VXU1 208 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 AP1ARQ63HQ0 302 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 TMEM71Q6P5X7 295 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 DEF8Q6ZN54 512 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PEX5LQ8IYB4 626 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 OR7G1Q8NGA0 311 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 OR4D9Q8NGE8 314 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ASB10Q8WXI3 467 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CDS1Q92903 461 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 C16orf58Q96GQ5 468 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 MAGED4Q96JG8 741 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ART5Q96L15 291 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 RIBC2Q9H4K1 309 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ARMC7Q9H6L4 198 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CXorf21Q9HAI6 301 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 SMURF2Q9HAU4 748 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PRODH2Q9UF12 536 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 TMCC3Q9ULS5 477 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 MGAT4BQ9UQ53 548 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CFL2Q9Y281 166 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 WDR45Q9Y484 360 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 CLDN16Q9Y5I7 305 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 MYO7BQ6PIF6 2116 aa5.98□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 DPPA5A6NC42 116 aa5.97□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 AGAP5A6NIR3 686 aa5.97□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 PRSS44E7EML9 344 aa5.97□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 M0R3H8 397 aa5.97□□□□□ -1.45
CCL20-202ENST00000409189 B4GAT1O43505 415 aa5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms