RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 C8orf44Q96CB5 159 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TEAD3Q99594 435 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CDADC1Q9BWV3 514 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ASPNQ9BXN1 380 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TGIF2Q9GZN2 237 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TPK1Q9H3S4 243 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SEC14L4Q9UDX3 406 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ICAM5Q9UMF0 924 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SSR3Q9UNL2 185 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FER1L5A0AVI2 2057 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR179Q6PRD1 2367 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM129A0AVI4 362 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 METTL15A6NJ78 407 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MCIDASD6RGH6 385 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MEN1O00255 615 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PLD2O14939 933 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPAN2O60636 221 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PPM1BO75688 479 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LALBAP00709 142 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 IFNGP01579 166 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CELP19835 753 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TACR3P29371 465 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SOX6P35712 828 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GRK6P43250 576 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF4P78317 190 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF117Q03924 483 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MXD1Q05195 221 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FHL1Q13642 323 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC157Q569K6 752 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM69BQ5VUD6 431 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5M10Q6IEU7 315 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TCEAL6Q6IPX3 200 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OVCH1Q7RTY7 1134 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD37Q7Z713 158 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SNX29P2Q8IUI4 249 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHL36Q8N4N3 616 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ACBD7Q8N6N7 88 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 DTWD2Q8NBA8 298 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PSD4Q8NDX1 1056 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM71CQ8NEG0 241 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR10H4Q8NGA5 316 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CEP76Q8TAP6 659 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 S100ZQ8WXG8 99 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TCEAL3Q969E4 200 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 DTNBP1Q96EV8 351 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TM9SF2Q99805 663 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CRB3Q9BUF7 120 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NUAK2Q9H093 628 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MMP27Q9H306 513 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FN3KQ9H479 309 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 AKIP1Q9NQ31 210 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NANSQ9NR45 359 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHL1Q9NR64 748 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SNTG1Q9NSN8 517 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NDUFB11Q9NX14 153 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ERVK13-1Q9NX77 482 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 STUB1Q9UNE7 303 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 DAPL1A0PJW8 107 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC22A31A6NKX4 558 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR6C76A6NM76 312 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TO15178 435 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR7A10O76100 309 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SYPP08247 313 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PNMTP11086 282 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NAT2P11245 290 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CPEP16870 476 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MST1P26927 711 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 S100A5P33763 92 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS19P39019 145 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 AQP2P41181 271 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LIMK1P53667 647 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PNLIPRP2P54317 469 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NRG3P56975 720 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS25P62851 125 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ERVK-25P63136 954 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 C22orf42Q6IC83 251 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 KLBQ86Z14 1044 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM99Q8N816 258 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 APCDD1LQ8NCL9 501 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MOSPD2Q8NHP6 518 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 DUSP19Q8WTR2 217 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 UFD1Q92890 307 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms