RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 CPT2P23786 658 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CLDN12P56749 244 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA1024LP59773 190 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TSSK4Q6SA08 328 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NAA40Q86UY6 237 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SULF2Q8IWU5 870 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZBTB8AQ96BR9 441 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FCRL1Q96LA6 429 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TEX37Q96LM6 180 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PINK1Q9BXM7 581 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RNF167Q9H6Y7 350 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 EGLN3Q9H6Z9 239 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 INPP5EQ9NRR6 644 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 V9GY05 133 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FADS1O60427 444 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 UGDHO60701 494 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 DPM1O60762 260 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TPPPO94811 219 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CT45A6P0DMU7 189 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CT45A5P0DMU8 189 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CT45A7P0DMV0 189 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CT45A8P0DMV1 189 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CT45A9P0DMV2 189 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ATP1B3P54709 279 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FXYD4P59646 89 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MPEG1Q2M385 716 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SVBPQ8N300 66 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NUDT8Q8WV74 236 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF75AQ96N20 296 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR52D1Q9H346 318 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0U1RQK1 487 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 DVL2O14641 736 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ACP2P11117 423 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SNCAP37840 140 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SRPXP78539 464 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NSDHLQ15738 373 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR5AR1Q8NGP9 310 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM163Q8TC26 289 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NPRL2Q8WTW4 380 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RSPRY1Q96DX4 576 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SEC22AQ96IW7 307 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HRASLS5Q96KN8 279 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PRRC1Q96M27 445 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 MICU1Q9BPX6 476 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CEBPZOSA8MTT3 80 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CASC3O15234 703 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 CCR7P32248 378 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SHC2P98077 582 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GPR50Q13585 617 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FAM69BQ5VUD6 431 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PGAP1Q75T13 922 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 NIPAL2Q9H841 368 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 DMRT3Q9NQL9 472 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 HHLA2Q9UM44 414 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 EVPLQ92817 2033 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PPE2 198 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PR64 198 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PRV1 198 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 GFRA2O00451 464 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SLC16A6O15403 523 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ALX3O95076 343 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 WDPCPO95876 746 aa8.28□□□□□ -1.08
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