RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389589.8

SHOX2-201, Transcript of short stature homeobox 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHOX2, Length 2,072 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOX2-201ENST00000389589 WWP2O00308 870 aa22.94■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 IGFN1Q86VF2 1251 aa22.94■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 KLHDC3Q9BQ90 382 aa22.94■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 C12orf71A8MTZ7 269 aa22.94■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 GDF9O60383 454 aa22.94■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ASAH2BP0C7U1 165 aa22.94■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 C16orf87Q6PH81 154 aa22.94■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 OR4K13Q8NH42 304 aa22.94■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ZNF229Q9UJW7 825 aa22.94■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 TMEM200CA6NKL6 621 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 B4E171 279 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 C9J4A7 227 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 APEHP13798 732 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 CCKBRP32239 447 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 TSPAN7P41732 249 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 B3GLCTQ6Y288 498 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 SDR9C7Q8NEX9 313 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 GPR119Q8TDV5 335 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 DUSP19Q8WTR2 217 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 TTC9Q92623 222 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 MR1Q95460 341 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 C8orf44Q96CB5 159 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 MOGAT1Q96PD6 335 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ASPNQ9BXN1 380 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 FKRPQ9H9S5 495 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 DAPL1A0PJW8 107 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 SLC30A4O14863 429 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 GMFGO60234 142 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 SBK2P0C263 348 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 AVPR2P30518 371 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 GABRA5P31644 462 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 CD79BP40259 229 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 TMED10P49755 219 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 FBXW4P57775 412 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 BDH1Q02338 343 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 LGALS3BPQ08380 585 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 QPRTQ15274 297 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 HGDQ93099 445 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 CDADC1Q9BWV3 514 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ULBP3Q9BZM4 244 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 SLC39A1Q9NY26 324 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa22.93■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 HIST1H2ABP04908 130 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 C17orf67Q0P5P2 114 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 GALEQ14376 348 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 LCN1P1Q5VSP4 162 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 TMEM99Q8N816 258 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 MOSPD2Q8NHP6 518 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 HIST1H2ACQ93077 130 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 KATNB1Q9BVA0 655 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ALG8Q9BVK2 526 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ADGRL4Q9HBW9 690 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 TAS2R10Q9NYW0 307 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ADAM10O14672 748 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 IMPA2O14732 288 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 PLD2O14939 933 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 SLC25A12O75746 678 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 CLUP10909 449 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 AQP2P41181 271 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ACTC1P68032 377 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ACTA1P68133 377 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 GRINAQ7Z429 371 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 OR10H4Q8NGA5 316 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 CMKLR1Q99788 373 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 MYOTQ9UBF9 498 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 CORINQ9Y5Q5 1042 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 C17orf51A8MQB3 221 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 CD14P08571 375 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 UQCRC1P31930 480 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 HTR3AP46098 478 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ERVK-25P63136 954 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 LTBQ06643 244 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 GXYLT1Q4G148 440 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 ALG10Q5BKT4 473 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SHOX2-201ENST00000389589 FAM198BQ6UWH4 519 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms