RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000386307.1

SNORD12C-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 12C, humanhuman

BASIC

Gene SNORD12C, Length 89 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD12C-201ENST00000386307 PARP11Q9NR21 331 aa0.3□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 EXD2Q9NVH0 621 aa0.3□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa0.3□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 C1orf123Q9NWV4 160 aa0.3□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 AIPL1Q9NZN9 384 aa0.3□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 CNIH4Q9P003 139 aa0.3□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 NDUFA13Q9P0J0 144 aa0.3□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 CD84Q9UIB8 345 aa0.3□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 RNF6Q9Y252 685 aa0.3□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 OARD1Q9Y530 152 aa0.3□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 SPACA6W5XKT8 324 aa0.3□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 TMEM223A0PJW6 202 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 PLAC8L1A1L4L8 177 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 CCDC69A6NI79 296 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 C12orf71A8MTZ7 269 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 VGLL3A8MV65 326 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 WASH3PC4AMC7 463 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 INS-IGF2F8WCM5 200 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 H3BMQ9 156 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 UBXN8O00124 270 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 HIP1O00291 1037 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 RAD51BO15315 384 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 CD5LO43866 347 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 IGLV2-23P01705 113 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 SMIM10L1P0DMW3 83 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 IGHV1-8P0DP01 117 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 ANXA3P12429 323 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 CXCR2P25025 360 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 DCKP27707 260 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 TGFBR2P37173 567 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 BIDP55957 195 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 HSD17B7P56937 341 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 KIAA1024LP59773 190 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 ESRRGP62508 458 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF616Q08AN1 781 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 RAB40BQ12829 278 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 IL15RAQ13261 267 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 LAGE3Q14657 143 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 ADPRMQ3LIE5 342 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 PARP10Q53GL7 1025 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 SLC10A5Q5PT55 438 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 AP1ARQ63HQ0 302 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 SPINT4Q6UDR6 99 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 C16orf54Q6UWD8 224 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 LYPD2Q6UXB3 125 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 WASH2PQ6VEQ5 465 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 HSDL2Q6YN16 418 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 LANCL3Q6ZV70 420 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 PCGF5Q86SE9 256 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 BIVMQ86UB2 503 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 OAFQ86UD1 273 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 EFCAB13Q8IY85 973 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 OR8H3Q8N146 312 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 LRRC52Q8N7C0 313 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF680Q8NEM1 530 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 OR2L3Q8NG85 312 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 OR1P1Q8NH06 330 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 PAQR8Q8TEZ7 354 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 GIPC3Q8TF64 312 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 RAPGEF5Q92565 580 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 NCLNQ969V3 563 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 SMIM10Q96HG1 83 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 CAMK2N2Q96S95 79 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF382Q96SR6 550 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 DUSP16Q9BY84 665 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 DNTTIP1Q9H147 329 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 C20orf85Q9H1P6 137 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 FOLH1BQ9HBA9 442 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 SGK2Q9HBY8 427 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 CTPS2Q9NRF8 586 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 DNAJB9Q9UBS3 223 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 CDH9Q9ULB4 789 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 AP4B1Q9Y6B7 739 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 NFASCO94856 1347 aa0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa0.28□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa0.28□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa0.28□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 A0A1B0GVX0 72 aa0.28□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 CCDC182A6NF36 153 aa0.28□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 FAM74A7A6NL05 159 aa0.28□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa0.28□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 SGK1O00141 431 aa0.28□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 LGALS8O00214 317 aa0.28□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 PRKYO43930 277 aa0.28□□□□□ -2.36
SNORD12C-201ENST00000386307 BGLAPP02818 100 aa0.28□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms