RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
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PTPRK-202ENST00000368205 MMP27Q9H306 513 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 DSN1Q9H410 356 aa3.07□□□□□ -1.92
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PTPRK-202ENST00000368205 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
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PTPRK-202ENST00000368205 A8MU76 341 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRK-202ENST00000368205 C15orf32Q32M92 178 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 TTLL9Q3SXZ7 439 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRK-202ENST00000368205 SPANXN4Q5MJ08 99 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.923e-6■■■■■ 29.3
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PTPRK-202ENST00000368205 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 OR2T29Q8NH02 315 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 PSMA8Q8TAA3 256 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 APH1BQ8WW43 257 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 GGHQ92820 318 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRK-202ENST00000368205 DNASE1L2Q92874 299 aa3.06□□□□□ -1.92
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