RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 TUBA1BP68363 451 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TUBA4AP68366 448 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A3Q00325 362 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TRAM2Q15035 370 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 OR8B8Q15620 311 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRC-201ENST00000348564 TSC22D1Q15714 1073 aa4.03□□□□□ -1.76
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PTPRC-201ENST00000348564 OR14I1A6ND48 311 aa4.02□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 MAP4K2Q12851 820 aa4.02□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 ODF4Q2M2E3 257 aa4.02□□□□□ -1.77
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PTPRC-201ENST00000348564 SATL1Q86VE3 508 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF610Q8N9Z0 462 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 BHLHE23Q8NDY6 225 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 OR6N2Q8NGY6 317 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB8AQ96BR9 441 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD27Q96NW4 1050 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRC-201ENST00000348564 BTBD10Q9BSF8 475 aa4.02□□□□□ -1.77
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