RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PKP3-201ENST00000331563 POLE3Q9NRF9 147 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-201ENST00000331563 TAS2R10Q9NYW0 307 aa16.78■□□□□ 0.28
PKP3-201ENST00000331563 A0A1B0GTQ1 180 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-201ENST00000331563 PLPP2O43688 288 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-201ENST00000331563 LEFTY1O75610 366 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-201ENST00000331563 PTHLHP12272 177 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-201ENST00000331563 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PKP3-201ENST00000331563 OR12D2P58182 307 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-201ENST00000331563 ARSIQ5FYB1 569 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-201ENST00000331563 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PKP3-201ENST00000331563 ADCK2Q7Z695 626 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-201ENST00000331563 GID4Q8IVV7 300 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-201ENST00000331563 TMIEQ8NEW7 156 aa16.77■□□□□ 0.28
PKP3-201ENST00000331563 F5H5P2 479 aa16.77■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 FPR3P25089 353 aa16.77■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 MST1P26927 711 aa16.77■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 OMPP47874 163 aa16.77■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 ST3GAL3Q11203 375 aa16.77■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 ZNF77Q15935 545 aa16.77■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 NKAIN4Q8IVV8 208 aa16.77■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 PNPLA2Q96AD5 504 aa16.77■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 DERL3Q96Q80 235 aa16.77■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 SLC25A32Q9H2D1 315 aa16.77■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 MED17Q9NVC6 651 aa16.77■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 AHSPQ9NZD4 102 aa16.77■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 SPEGQ15772 3267 aa16.77■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 F5P12259 2224 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 CBR1P16152 277 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 NDUFV2P19404 249 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 ACHEP22303 614 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 H2BFSP57053 126 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 PGAP1Q75T13 922 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 SPAG16Q8N0X2 631 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 CAMK1GQ96NX5 476 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 UFSP2Q9NUQ7 469 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 NTNG1Q9Y2I2 539 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 PBX2P40425 430 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 AKR1C2P52895 323 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 SORDQ00796 357 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 AKR1C1Q04828 323 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 ZNF311Q5JNZ3 666 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 UBE2NLQ5JXB2 153 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 C11orf96Q7Z7L8 435 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 C1orf216Q8TAB5 229 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 TIMP4Q99727 224 aa16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 DENND4AQ7Z401 1863 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 BRWD1Q9NSI6 2320 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 C2orf74A8MZ97 194 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 CTDSPLO15194 276 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 CTSLP07711 333 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 CHRM4P08173 479 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 SFTPCP11686 197 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 DCTDP32321 178 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 CD96P40200 585 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 ELFN2Q5R3F8 820 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 Q6ZVL8 140 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 PXKQ7Z7A4 578 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 OR10H1Q9Y4A9 318 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 SNRPGP15A8MWD9 76 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 ART1P52961 327 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 C2orf68Q2NKX9 166 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 NIPAL3Q6P499 406 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 ZNF620Q6ZNG0 422 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 PEX11GQ96HA9 241 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 F2RL3Q96RI0 385 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 LYSMD1Q96S90 227 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 TCEAL7Q9BRU2 100 aa16.75■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 ARGFXA6NJG6 315 aa16.74■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 WASH3PC4AMC7 463 aa16.74■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 GABARAPH6UMI1 98 aa16.74■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 AQP8O94778 261 aa16.74■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 TAS2R43P59537 309 aa16.74■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 OR7E24Q6IFN5 339 aa16.74■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 NXPE4Q6UWF7 544 aa16.74■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 CACUL1Q86Y37 369 aa16.74■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa16.74■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 UBQLN3Q9H347 655 aa16.74■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 GHRLQ9UBU3 117 aa16.74■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa16.74■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 CDHR4A6H8M9 788 aa16.74■□□□□ 0.27
PKP3-201ENST00000331563 DBX1A6NMT0 343 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms