RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 RAD9AQ99638 391 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 STRCQ7RTU9 1775 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 LANCL1O43813 399 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 RDH16O75452 317 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SBK2P0C263 348 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SLC2A5P22732 501 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 AGTR1P30556 359 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 MAP2K6P52564 334 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TNFRSF17Q02223 184 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 DECR1Q16698 335 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 HTR3DQ70Z44 454 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TMEM150AQ86TG1 271 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 RASD2Q96D21 266 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 HSD11B1P28845 292 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 S100A2P29034 98 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 NOGQ13253 232 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 GRM7Q14831 915 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 DMRTC1Q5HYR2 192 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SLC38A3Q99624 504 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.57□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 A0A1W2PR48 441 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 NFATC4Q14934 902 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TMEM64Q6YI46 380 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TPRA1Q86W33 373 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ZBTB8AQ96BR9 441 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 RGCCQ9H4X1 137 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 FOCADQ5VW36 1801 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 MAOBP27338 520 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 RAB5BP61020 215 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 BTG1P62324 171 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 DYRK1AQ13627 763 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 PDE7AQ13946 482 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 DUSP6Q16828 381 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ST3GAL2Q16842 350 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CARD17Q5XLA6 110 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ZNF550Q7Z398 422 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CMTM4Q8IZR5 234 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 BPIFB2Q8N4F0 458 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ASB6Q9NWX5 421 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 LEUTXA8MZ59 168 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 E9PI62 339 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CD160O95971 181 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ACSM4P0C7M7 580 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 RAB6AP20340 208 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 POU4F2Q12837 409 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 KCNAB1Q14722 419 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ALG10Q5BKT4 473 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 FIGLAQ6QHK4 219 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 OR52N1Q8NH53 320 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 GPR148Q8TDV2 347 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.56□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 GMDSO60547 372 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 HOXB5P09067 269 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ACHEP22303 614 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CCR9P51686 369 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 NRG3P56975 720 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CMIPQ8IY22 773 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 MAFFQ9ULX9 164 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CLEC3AO75596 197 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 SRMP19623 302 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 CDK3Q00526 305 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TMUB2Q71RG4 321 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 DPPA4Q7L190 304 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ESX1Q8N693 406 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 OR4D11Q8NGI4 311 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ZNF649Q9BS31 505 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.55□□□□□ -0.08
USP43-201ENST00000285199 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms