RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283882.3

CFDP1-201, Transcript of craniofacial development protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFDP1, Length 1,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1-201ENST00000283882 FUT1P19526 365 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 POU1F1P28069 291 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 SLC6A6P31641 620 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 GRK5P34947 590 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 DNASE1L1P49184 302 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 FXYD6P3P58550 94 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 PRPS1P60891 318 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 CSNK2BP67870 215 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 IL5RAQ01344 420 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 FHL1Q13642 323 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 GINS1Q14691 196 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 HYAL4Q2M3T9 481 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 DEFB109BQ30KR1 87 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 PGGHGQ32M88 737 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM201Q5SNT2 666 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 SLC25A30Q5SVS4 291 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 SLC25A25Q6KCM7 469 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 CASP12Q6UXS9 341 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 LINC00696Q6ZRV3 163 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 ENTHD1Q8IYW4 607 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 OR2M7Q8NG81 312 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 OR8J1Q8NGP2 316 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 OR13C2Q8NGS9 318 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 C5orf34Q96MH7 638 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 SLC38A2Q96QD8 506 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 PTDSS2Q9BVG9 487 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 TSSK6Q9BXA6 273 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 EGLN3Q9H6Z9 239 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 MCCC2Q9HCC0 563 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 NANSQ9NR45 359 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 DEPPQ9NTK1 212 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 QPCTLQ9NXS2 382 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 B4GALT7Q9UBV7 327 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 DKKL1Q9UK85 242 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 RNF6Q9Y252 685 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 VDAC3Q9Y277 283 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 CORINQ9Y5Q5 1042 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 APC2O95996 2303 aa11.3□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 ASPMQ8IZT6 3477 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 CACNA1AO00555 2505 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 A0A0G2JMM0 328 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 A0A1W2PPB8 328 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 A0A1W2PRS3 328 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 SH3D21A4FU49 640 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 KIR3DP1A8MWS1 328 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 FTCDNL1E5RQL4 147 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 LINC01387J3KSC0 135 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 BHLHE40O14503 412 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 CH25HO95992 272 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 SP1P08047 785 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 APEHP13798 732 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 HK1P19367 917 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 PTNP21246 168 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 UQCRC1P31930 480 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 PLA2G5P39877 138 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 ID4P47928 161 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 PCYT1AP49585 367 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 UCNP55089 124 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 GABARAPL2P60520 117 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 CDK5R2Q13319 367 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 SYT14P1Q58G82 188 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 C6orf141Q5SZD1 244 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 SPINK14Q6IE38 97 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 P3H2Q8IVL5 708 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 SPACA3Q8IXA5 215 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF786Q8N393 782 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 LNX2Q8N448 690 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 SCAIQ8N9R8 606 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM178AQ8NBL3 297 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 ANKK1Q8NFD2 765 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 FDCSPQ8NFU4 85 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 MFSD8Q8NHS3 518 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 TAAR8Q969N4 342 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 FAM122AQ96E09 287 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 SAMD8Q96LT4 415 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 PIGQQ9BRB3 760 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 SLC6A5Q9Y345 797 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 TRAV27A0A087WT01 109 aa11.28□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa11.28□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 ARPC3O15145 178 aa11.28□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 RRP8O43159 456 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CFDP1-201ENST00000283882 IDH3BO43837 385 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms