RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278833.3

ROM1-201, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ROM1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-201ENST00000278833 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 FAM27D1Q5T7N8 215 aa22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 OVCH1Q7RTY7 1134 aa22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 PLCZ1Q86YW0 608 aa22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 SFTPA2Q8IWL1 248 aa22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 UBE2J2Q8N2K1 259 aa22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 RCBTB1Q8NDN9 531 aa22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 LIPHQ8WWY8 451 aa22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 PELI1Q96FA3 418 aa22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 GON7Q9BXV9 100 aa22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 ZNF337Q9Y3M9 751 aa22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa22.98■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 SHISA7A6NL88 538 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 GPRIN2O60269 458 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 OR7A10O76100 309 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 CT45A8P0DMV1 189 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 CT45A9P0DMV2 189 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 STX4Q12846 297 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 BIKQ13323 160 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 MADCAM1Q13477 382 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 CCINQ13939 588 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 CT45A2Q5DJT8 189 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 ZNF438Q7Z4V0 828 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 SLC35F2Q8IXU6 374 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 SIX5Q8N196 739 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 DGAT2Q96PD7 388 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 TMEM246Q9BRR3 403 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 NRIP3Q9NQ35 241 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 ING3Q9NXR8 418 aa22.97■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 UBL3O95164 117 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 CD83Q01151 205 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 EFR3AQ14156 821 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 GLCCI1Q86VQ1 547 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 YIPF7Q8N8F6 280 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 GRPEL2Q8TAA5 225 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 HDHD2Q9H0R4 259 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 DTX4Q9Y2E6 619 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 MCIDASD6RGH6 385 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 CTDSPLO15194 276 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 TFPIP10646 304 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 APEHP13798 732 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 GLULP15104 373 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 GDI2P50395 445 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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ROM1-201ENST00000278833 DEFB110Q30KQ9 67 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 NPEPL1Q8NDH3 523 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 SDR9C7Q8NEX9 313 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 TCTN2Q96GX1 697 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 MSANTD3Q96H12 275 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 ACOXLQ9NUZ1 547 aa22.96■■□□□ 1.27
ROM1-201ENST00000278833 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 C7orf66A4D0T2 115 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 I3L1I5 382 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 CLDN4O14493 209 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 FZD7O75084 574 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 THEGLP0DJG4 465 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 BTCP35070 178 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 ACVR1BP36896 505 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 MMP15P51511 669 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 HSD17B7P56937 341 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 PRPS1P60891 318 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 SIRPAP78324 504 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 PITPNAQ00169 270 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 PON3Q15166 354 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 HSD17B12Q53GQ0 312 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 BCORP1Q8N888 145 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 C3orf49Q96BT1 292 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 SPACA7Q96KW9 195 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 CACNG2Q9Y698 323 aa22.95■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 CSTAP01040 98 aa22.94■■□□□ 1.26
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ROM1-201ENST00000278833 CTSBP07858 339 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 CTSEP14091 401 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 FASLGP48023 281 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 GABRA4P48169 554 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 CEP78Q5JTW2 689 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 FNDC7Q5VTL7 733 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 IL20RBQ6UXL0 311 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 RPTNQ6XPR3 784 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 PARGQ86W56 976 aa22.94■■□□□ 1.26
ROM1-201ENST00000278833 GPR135Q8IZ08 494 aa22.94■■□□□ 1.26
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