RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265616.9

UBXN8-201, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN8, Length 1,450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-201ENST00000265616 STOMP27105 288 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 MAOBP27338 520 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 HTR2AP28223 471 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 CENPAP49450 140 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 SLC25A1P53007 311 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 PRPS1P60891 318 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 GPR176Q14439 515 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 P2RY14Q15391 338 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 LTB4RQ15722 352 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 CARTPTQ16568 116 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 EMC4Q5J8M3 183 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 Q6ZS46 218 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 SPRED2Q7Z698 418 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 KCT2Q8NC54 265 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 OR56B4Q8NH76 319 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 OR14C36Q8NHC7 312 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 NSMAFQ92636 917 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 PTP4A1Q93096 173 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 UPRTQ96BW1 309 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 IFT27Q9BW83 186 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 GHITMQ9H3K2 345 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 LRRN3Q9H3W5 708 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 SERGEFQ9UGK8 458 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 CHRNA9Q9UGM1 479 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 MOKQ9UQ07 419 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 ETV7Q9Y603 341 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 CACNG2Q9Y698 323 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.17□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 SHISA3A0PJX4 238 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 OR6C70A6NIJ9 312 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 LRRC72A6NJI9 287 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 K7EQS6 105 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 FLRT2O43155 660 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 LATO43561 262 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 PIP5K1CO60331 668 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 FZD7O75084 574 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 IFNA16P05015 189 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 CHRNB1P11230 501 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 ANXA3P12429 323 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 MAKP20794 623 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 NT5EP21589 574 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 DIO1P49895 249 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 ZNF85Q03923 595 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 FGFBP1Q14512 234 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 CDK5R1Q15078 307 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 POU4F3Q15319 338 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 ZNF750Q32MQ0 723 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 DEFB134Q4QY38 66 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 IDNKQ5T6J7 187 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 FCRL6Q6DN72 434 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 TMEM99Q8N816 258 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 GPBAR1Q8TDU6 330 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 C17orf50Q8WW18 174 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 RAB40AQ8WXH6 277 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 OR1E3Q8WZA6 343 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 SMPDL3BQ92485 455 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 GSDMCQ9BYG8 508 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 DPH1Q9BZG8 443 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 MED28Q9H204 178 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 ABCG5Q9H222 651 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 UCK1Q9HA47 277 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.16□□□□□ -1.26
UBXN8-201ENST00000265616 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms