RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 TSSK6Q9BXA6 273 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 ENKD1Q9H0I2 346 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 SERINC1Q9NRX5 453 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 IL20RAQ9UHF4 553 aa20.49■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 RCBTB2O95199 551 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 MYBPC1Q00872 1141 aa20.48■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 SLC27A4Q6P1M0 643 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 SMARCD3Q6STE5 483 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 FBLIM1Q8WUP2 373 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 DDIT4LQ96D03 193 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 DNAJA3Q96EY1 480 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 MCCC2Q9HCC0 563 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 NANSQ9NR45 359 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 CSAG2Q9Y5P2 127 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 SMSP52788 366 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 CDC42P60953 191 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 TOMM20Q15388 145 aa20.48■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 FAM69AQ5T7M9 428 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 C3orf33Q6P1S2 294 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 ENTHD1Q8IYW4 607 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa20.48■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 RNF6Q9Y252 685 aa20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 APC2O95996 2303 aa20.47■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 ZNF17P17021 662 aa20.47■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 SELENBP1Q13228 472 aa20.47■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 THSD4Q6ZMP0 1018 aa20.47■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 ZNF229Q9UJW7 825 aa20.47■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 H3BML4 177 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 K7ENP7 123 aa20.46■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 GDF1P27539 372 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 MEOX1P50221 254 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 ZNF226Q9NYT6 803 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 AASSQ9UDR5 926 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 LOC400499M0QZD8 3231 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 OR2M5A3KFT3 312 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 M0R129 80 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 OR2T1O43869 369 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 ELK4P28324 431 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 B3GALT5-AS1P59052 145 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 CDK5R2Q13319 367 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 SYT14P1Q58G82 188 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 LAIR2Q6ISS4 152 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 TMEM178AQ8NBL3 297 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 OR6S1Q8NH40 331 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.46■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 TTTY12Q9BZ98 90 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 OR2B2Q9GZK3 357 aa20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
UFD1-201ENST00000263202 HIF3AQ9Y2N7 669 aa20.46■□□□□ 0.87
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UFD1-201ENST00000263202 TFPIP10646 304 aa20.45■□□□□ 0.86
UFD1-201ENST00000263202 PEPDP12955 493 aa20.45■□□□□ 0.86
UFD1-201ENST00000263202 RFC3P40938 356 aa20.45■□□□□ 0.86
UFD1-201ENST00000263202 PGGHGQ32M88 737 aa20.45■□□□□ 0.86
UFD1-201ENST00000263202 GXYLT1Q4G148 440 aa20.45■□□□□ 0.86
UFD1-201ENST00000263202 CASP12Q6UXS9 341 aa20.45■□□□□ 0.86
UFD1-201ENST00000263202 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
UFD1-201ENST00000263202 ZNF786Q8N393 782 aa20.45■□□□□ 0.86
UFD1-201ENST00000263202 OR2T33Q8NG76 320 aa20.45■□□□□ 0.86
UFD1-201ENST00000263202 OR14L1PQ8NHC6 308 aa20.45■□□□□ 0.86
UFD1-201ENST00000263202 RHOXF1Q8NHV9 184 aa20.45■□□□□ 0.86
UFD1-201ENST00000263202 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
UFD1-201ENST00000263202 SLC25A36Q96CQ1 311 aa20.45■□□□□ 0.86
UFD1-201ENST00000263202 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.45■□□□□ 0.86
UFD1-201ENST00000263202 TMEM185BQ9H7F4 350 aa20.45■□□□□ 0.86
UFD1-201ENST00000263202 B4GALT7Q9UBV7 327 aa20.45■□□□□ 0.86
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