RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 TSSK4Q6SA08 328 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SSX6Q7RTT6 188 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ZNF100Q8IYN0 542 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ELMOD2Q8IZ81 293 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 RDH10Q8IZV5 341 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 LRRC18Q8N456 261 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MFSD9Q8NBP5 474 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ACBD4Q8NC06 268 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SYNPRQ8TBG9 265 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 UBTD2Q8WUN7 234 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ZFPM2Q8WW38 1151 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 UCN3Q969E3 161 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SLC35A4Q96G79 324 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MRGPRX1Q96LB2 322 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 NEDD4LQ96PU5 975 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 OR14A2Q96R54 314 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ALG12Q9BV10 488 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MLXQ9UH92 298 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MED16Q9Y2X0 877 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MAB21L2Q9Y586 359 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 KCNE3Q9Y6H6 103 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MYOFQ9NZM1 2061 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 COL24A1Q17RW2 1714 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ARAP2Q8WZ64 1704 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 LAMB2P55268 1798 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 NPC1O15118 1278 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SSX5O60225 188 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CSO75390 466 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CD160O95971 181 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 IGHV3-9P01782 118 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 DBHP09172 617 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CHRNB1P11230 501 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CD79AP11912 226 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 TNFRSF4P43489 277 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 GFERP55789 205 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 PRPS1P60891 318 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 REEP5Q00765 189 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 FOXK2Q01167 660 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 HNF4GQ14541 408 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 KCNJ8Q15842 424 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 LRIF1Q5T3J3 769 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 PYHIN1Q6K0P9 492 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 LAS2Q8IYD9 372 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 OR13C9Q8NGT0 318 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CREB3L1Q96BA8 519 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 C8orf44Q96CB5 159 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 BORCS8Q96FH0 119 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SEC22AQ96IW7 307 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SGCZQ96LD1 299 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 OR6C1Q96RD1 312 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MBOAT4Q96T53 435 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 HINT2Q9BX68 163 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 NTN4Q9HB63 628 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 C1GALT1Q9NS00 363 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 DAPP1Q9UN19 280 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 V9GY05 133 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 CCDC88CQ9P219 2028 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SYNGR4O95473 234 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ACY1Q03154 408 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MESP2Q0VG99 397 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 POU4F2Q12837 409 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 FGL2Q14314 439 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 SYT14P1Q58G82 188 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 Q6ZNB5 142 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 TMPPEQ6ZT21 453 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 MARCH3Q86UD3 253 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 EGFL6Q8IUX8 553 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ZNF440Q8IYI8 595 aa5.11□□□□□ -1.59
LMO3-201ENST00000261169 ANKRD53Q8N9V6 530 aa5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms