RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 RPS4Y2Q8TD47 263 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX33Q8WV41 574 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 DERL3Q96Q80 235 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 BEX1Q9HBH7 125 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 DPP7Q9UHL4 492 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1W2PQU0 124 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CIB4A0PJX0 185 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 GABARAPH6UMI1 98 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 LDB3O75112 727 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CFDP00746 253 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 EDNRAP25101 427 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 BLVRAP53004 296 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 METTL11BQ5VVY1 283 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 Q6ZTK2 550 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 LINGO2Q7L985 606 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CEP76Q8TAP6 659 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SRMSQ9H3Y6 488 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 FLVCR2Q9UPI3 526 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SCN3AQ9NY46 2000 aa20.35■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 TUBAL3A6NHL2 446 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 PIN1P1O15428 100 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 DPP4P27487 766 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 ZSWIM7Q19AV6 140 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM255AQ5JRV8 349 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 ABHD13Q7L211 337 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SIX5Q8N196 739 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 FTMTQ8N4E7 242 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC25A38Q96DW6 304 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 PTCHD1Q96NR3 888 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 OR2M4Q96R27 311 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM2Q9C040 744 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 NOX4Q9NPH5 578 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 NCDNQ9UBB6 729 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 GNG8Q9UK08 70 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 MAB21L2Q9Y586 359 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 PDCD5O14737 125 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAM11O75078 769 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 NKX2-2O95096 273 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 NDUFB2O95178 105 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR75O95800 540 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 DIO1P49895 249 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 AP3S2P59780 193 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 DHODHQ02127 395 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 KIR2DS3Q14952 304 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 FCRL6Q6DN72 434 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 LSMEM1Q8N8F7 131 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CLIP3Q96DZ5 547 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 OMA1Q96E52 524 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC120Q96HB5 630 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 GSX2Q9BZM3 304 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 PILRAQ9UKJ1 303 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 IFITM5A6NNB3 132 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 AIPO00170 330 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM52Q8NDY8 209 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 OR52I2Q8NH67 350 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CTHRC1Q96CG8 243 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL9Q9P2J3 617 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXL3Q9UKT7 428 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 M0R233 179 aa20.33■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 SULT1B1O43704 296 aa20.33■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 OR7A10O76100 309 aa20.33■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CT62P0C5K7 136 aa20.33■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB14P61106 215 aa20.33■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 OR6V1Q8N148 313 aa20.33■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CAMKVQ8NCB2 501 aa20.33■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 OBP2AQ9NY56 170 aa20.33■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 POMT2Q9UKY4 750 aa20.33■□□□□ 0.85
HTATSF1-201ENST00000218364 PRSS38A1L453 326 aa20.33■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF860A6NHJ4 632 aa20.33■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 VEGFCP49767 419 aa20.33■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 LGALS3BPQ08380 585 aa20.33■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 RUNX3Q13761 415 aa20.33■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 PON3Q15166 354 aa20.33■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 ALG10BQ5I7T1 473 aa20.33■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 SPICQ8N5J4 248 aa20.33■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 FGF13Q92913 245 aa20.33■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 COPS3Q9UNS2 423 aa20.33■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa20.33■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 CYR61O00622 381 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 SCO1O75880 301 aa20.32■□□□□ 0.84
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT33AO76009 404 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms