RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040584.5

HOXC8-201, Transcript of homeobox C8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC8, Length 1,889 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8-201ENST00000040584 COPZ1P61923 177 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 ST3GAL3Q11203 375 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 NTRK2Q16620 822 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 SPANXN2Q5MJ10 180 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 H3F3CQ6NXT2 135 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 IL20RBQ6UXL0 311 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF550Q7Z398 422 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 CADM3Q8N126 398 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 PSMF1Q92530 271 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 TTC9Q92623 222 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 OR5M11Q96RB7 305 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 NUAK2Q9H093 628 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 ANKRD19PQ9H560 264 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF229Q9UJW7 825 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXC8-201ENST00000040584 PRKAR1AP10644 381 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 IFNA8P32881 189 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 SSR4P51571 173 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 SKP2Q13309 424 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 SPHARQ15513 63 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 OR1Q1Q15612 314 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 BICRALQ6AI39 1079 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 PODNL1Q6PEZ8 512 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 OPN5Q6U736 354 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 GDF7Q7Z4P5 450 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 PARP16Q8N5Y8 322 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 ASB15Q8WXK1 588 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 SLC41A3Q96GZ6 507 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 IL4I1Q96RQ9 567 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF559Q9BR84 538 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 ADAM10O14672 748 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 GMFGO60234 142 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 TRAM2Q15035 370 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 KLHL22Q53GT1 634 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 C1orf94Q6P1W5 598 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 NANOGP1Q8N7R0 232 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 CCDC32Q9BV29 185 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 TRAPPC13A5PLN9 417 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 C2orf72A6NCS6 295 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 M0R129 80 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 NTN1O95631 604 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 ITGA3P26006 1051 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 CCR4P51679 360 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF117Q03924 483 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF440Q8IYI8 595 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 TMEM156Q8N614 296 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 LSMEM1Q8N8F7 131 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 OPALINQ96PE5 141 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 KLHDC3Q9BQ90 382 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 GALNT9Q9HCQ5 603 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 DOCK10Q96BY6 2186 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 HEATR5AQ86XA9 2040 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 HCRTR2O43614 444 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 ACER2Q5QJU3 275 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF613Q6PF04 617 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 SNX29P2Q8IUI4 249 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 DUSP19Q8WTR2 217 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 LAT2Q9GZY6 243 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 TMEM27Q9HBJ8 222 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 SLC7A7Q9UM01 511 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 TBX1O43435 398 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 LYPD3O95274 346 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 PCYT1AP49585 367 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 SMSP52788 366 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 CCDC190Q86UF4 302 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 NKAIN4Q8IVV8 208 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 CADM2Q8N3J6 435 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 POC5Q8NA72 575 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 CLEC1AQ8NC01 280 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 RNF138Q8WVD3 245 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 CEP19Q96LK0 163 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 TSSK6Q9BXA6 273 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 PRRG3Q9BZD7 231 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 TRIM2Q9C040 744 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 METTL7AQ9H8H3 244 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 ANKRD10Q9NXR5 420 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 KLRF1Q9NZS2 232 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 STUB1Q9UNE7 303 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 SPTBN4Q9H254 2564 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 PIEZO1Q92508 2521 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 A0A087WUU8 490 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 ARGFXA6NJG6 315 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 GIPRP48546 466 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 CDK5Q00535 292 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 ZNF91Q05481 1191 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXC8-201ENST00000040584 SSX1Q16384 188 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms