RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619245.1

ACACA-244, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

TSL 3

Gene ACACA, Length 635 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-244	ENST00000619245	NAAA	Q02083	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	MVK	Q03426	396 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	TRADD	Q15628	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	CBLN3	Q6UW01	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	MISP	Q8IVT2	679 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	JADE3	Q92613	823 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	RDH5	Q92781	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	YIPF5	Q969M3	257 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	CITED1	Q99966	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	HHATL	Q9HCP6	504 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACACA-244	ENST00000619245	RYR2	Q92736	4967 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SYCE1L	A8MT33	242 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245		M0R233	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	PDLIM1	O00151	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SULT2B1	O00204	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	EBAG9	O00559	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	PSMG1	O95456	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	PDYN	P01213	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	NGFR	P08138	427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	MPG	P29372	298 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	NTS	P30990	170 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ALDH3B1	P43353	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	CCT5	P48643	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	RAG2	P55895	527 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	TGFBR3	Q03167	851 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	HGFAC	Q04756	655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SAXO2	Q658L1	398 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	OR2L13	Q8N349	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ZNF614	Q8N883	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACACA-244	ENST00000619245	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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