RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 RGS10O43665 173 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 LYPD3O95274 346 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 WISP1O95388 367 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 IFNGP01579 166 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 THY1P04216 161 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 GRK5P34947 590 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 CHAF1BQ13112 559 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 TBR1Q16650 682 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 NDUFAF6Q330K2 333 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 STX19Q8N4C7 294 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 SGCZQ96LD1 299 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 TUBA1CQ9BQE3 449 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 CDCP1Q9H5V8 836 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 SERINC1Q9NRX5 453 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF337Q9Y3M9 751 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 FER1L5A0AVI2 2057 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 A6NHS1 94 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 ENO4A6NNW6 628 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 KLF4O43474 513 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 PIP5K1CO60331 668 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 NDUFB2O95178 105 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM87AP0C7U9 286 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 SMIM18P0DKX4 95 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 PAICSP22234 425 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 EPHA2P29317 976 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 TACR3P29371 465 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 FMO3P31513 532 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 MLF1P58340 268 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRPS1P60891 318 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 MFSD13AQ14CX5 517 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 OCLNQ16625 522 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZBED5Q49AG3 693 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 ISLR2Q6UXK2 745 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 APOOLQ6UXV4 268 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPR141Q7Z602 305 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 MRGPREQ86SM8 312 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR4K17Q8NGC6 315 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 PFN4Q8NHR9 129 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR52D1Q9H346 318 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 WIF1Q9Y5W5 379 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 MYO18BQ8IUG5 2567 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 DPPA5A6NC42 116 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLCA1A8K7I4 914 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR2T1O43869 369 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR7A10O76100 309 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 NOS3P29474 1203 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPS18P62269 152 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLAURQ03405 335 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 QPRTQ15274 297 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 PGGHGQ32M88 737 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 KLHL22Q53GT1 634 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC25A30Q5SVS4 291 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM236Q5W0B7 351 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC22A10Q63ZE4 541 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 CBLN3Q6UW01 205 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARMC10Q8N2F6 343 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM26EQ8N5C1 309 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 TCEANCQ8N8B7 351 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLEC1AQ8NC01 280 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM163Q8TC26 289 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 FCGR1BQ92637 280 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 NKD1Q969G9 470 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 COPS4Q9BT78 406 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 IFT27Q9BW83 186 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 ADAM19Q9H013 955 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 EGLN3Q9H6Z9 239 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC6A5Q9Y345 797 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAPPC3-210ENST00000617904 BSNQ9UPA5 3926 aa15.27■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 A0A087WZY1 265 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC160A6NGH7 325 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM200CA6NKL6 621 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 TRIM64CA6NLI5 447 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 RIIAD1A6NNX1 92 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 SNX4O95219 450 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 AHSA1O95433 338 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 MT-ATP6P00846 226 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 P04436 131 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 FUT1P19526 365 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 FUT4P22083 530 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 SOX3P41225 446 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 EIF1P41567 113 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 RRADP55042 308 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM201Q5SNT2 666 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 IL20RBQ6UXL0 311 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAPPC3-210ENST00000617904 WDR88Q6ZMY6 472 aa15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms