RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598258.5

TMEM143-208, Transcript of transmembrane protein 143, human

TSL 4

Gene TMEM143, Length 457 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM143-208	ENST00000598258	GJE1	A6NN92	205 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	EVPLL	A8MZ36	301 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	C5orf58	C9J3I9	102 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	SULT2B1	O00204	365 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	NPIPB7	O75200	414 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	PMS2P2	O95744	297 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	THBD	P07204	575 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	CD247	P20963	164 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	PTN	P21246	168 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	SLC6A2	P23975	617 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	UGT2B10	P36537	528 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	P2RY4	P51582	365 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	H3F3A	P84243	136 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	GNA13	Q14344	377 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	CYP51A1	Q16850	503 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	HIPK4	Q8NE63	616 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	ZNF583	Q96ND8	569 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	FAM107B	Q9H098	131 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	BCO1	Q9HAY6	547 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	PRSS50	Q9UI38	385 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	ROS1	P08922	2347 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	SH3D21	A4FU49	640 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258		A6NNC1	897 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258		M0QX08	132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258		M0R3H8	397 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	ZNF208	O43345	1280 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	PRKD3	O94806	890 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	THY1	P04216	161 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	EPX	P11678	715 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	FPR1	P21462	350 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	PCGF2	P35227	344 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	CTBP2	P56545	445 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	POU4F3	Q15319	338 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	COQ5	Q5HYK3	327 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	SPATA21	Q7Z572	469 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	P3H2	Q8IVL5	708 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	FAM222B	Q8WU58	562 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	RASSF1	Q9NS23	344 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	CMTM6	Q9NX76	183 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	CAD	P27708	2225 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258		A0A1B0GWA3	101 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	TMEM247	A6NEH6	219 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	LIPT2	A6NK58	231 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	SNX3	O60493	162 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	LYPD3	O95274	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	YES1	P07947	543 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	COX4I1	P13073	169 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	POU2F1	P14859	743 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	HTR3A	P46098	478 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	OR2B6	P58173	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	VMAC	Q2NL98	169 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	KIF18B	Q86Y91	864 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	TMEM99	Q8N816	258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	ARHGDIG	Q99819	225 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	GLRX2	Q9NS18	164 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	AKR7A3	O95154	331 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	HRG	P04196	525 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	TNFRSF1B	P20333	461 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	FUT4	P22083	530 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	KCNJ5	P48544	419 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TMEM143-208	ENST00000598258	GNGT1	P63211	74 aa		13.54	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms