RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 APH1AQ96BI3 265 aa10.65□□□□□ -0.7
CTIF-208ENST00000590422 CACNG6Q9BXT2 260 aa10.65□□□□□ -0.7
CTIF-208ENST00000590422 GRIP2Q9C0E4 1043 aa10.65□□□□□ -0.7
CTIF-208ENST00000590422 AKTIPQ9H8T0 292 aa10.65□□□□□ -0.7
CTIF-208ENST00000590422 SERINC1Q9NRX5 453 aa10.65□□□□□ -0.7
CTIF-208ENST00000590422 PNPOQ9NVS9 261 aa10.65□□□□□ -0.7
CTIF-208ENST00000590422 EMC3Q9P0I2 261 aa10.65□□□□□ -0.7
CTIF-208ENST00000590422 MALT1Q9UDY8 824 aa10.65□□□□□ -0.7
CTIF-208ENST00000590422 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CTIF-208ENST00000590422 WDR45Q9Y484 360 aa10.65□□□□□ -0.7
CTIF-208ENST00000590422 SLC25A15Q9Y619 301 aa10.65□□□□□ -0.7
CTIF-208ENST00000590422 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa10.65□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 AP3D1O14617 1153 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 EDF1O60869 148 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 PMS2P2O95744 297 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 VIMP08670 466 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 CCNA2P20248 432 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 CD40P25942 277 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 RPL14P50914 215 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 GNGT1P63211 74 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 SLC25A3Q00325 362 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 CHRNEQ04844 493 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 PDK3Q15120 406 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 SAXO2Q658L1 398 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 HMBOX1Q6NT76 420 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 SLC22A25Q6T423 547 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 GRINAQ7Z429 371 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 P2RY8Q86VZ1 359 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 ADGRG3Q86Y34 549 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 LRRC34Q8IZ02 419 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 KIRREL3Q8IZU9 778 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 OR8J2Q8NGG1 315 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 OR52E4Q8NGH9 312 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 XAGE5Q8WWM1 108 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 ROPN1LQ96C74 230 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 SAP130Q9H0E3 1048 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 EXD2Q9NVH0 621 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 FAIMQ9NVQ4 179 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa10.64□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 CIB4A0PJX0 185 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 FAM234BA2RU67 622 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 CCT8L1PA6NM43 557 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 PDLIM1O00151 329 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 TTKP33981 857 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 NUDT6P53370 316 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 SLC16A1P53985 500 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 NRF1Q16656 503 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 SPANXN4Q5MJ08 99 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 C9orf135Q5VTT2 229 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 AGAP6Q5VW22 663 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 TMEM108Q6UXF1 575 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 HIPK1Q86Z02 1210 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 PHC2Q8IXK0 858 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 ZNF525Q8N782 197 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 WDR31Q8NA23 367 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 OR10H5Q8NGA6 315 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 ZNF563Q8TA94 476 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 PIGXQ8TBF5 258 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 NEURL3Q96EH8 262 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 DPY30Q9C005 99 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 ASB6Q9NWX5 421 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 TAS2R16Q9NYV7 291 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 POU2F3Q9UKI9 436 aa10.63□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 SVEP1Q4LDE5 3571 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 GMNCA6NCL1 334 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 RNF212BA8MTL3 300 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 M0R1B8 84 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 HMGN4O00479 90 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 HDAC3O15379 428 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 LY6HO94772 140 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 CHRM4P08173 479 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 GUSBP08236 651 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 IMPDH2P12268 514 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 UQCRC2P22695 453 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 PTAFRP25105 342 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 IDH2P48735 452 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 KHKP50053 298 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 SEC24CP53992 1094 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 OR2B6P58173 313 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 KCNJ10P78508 379 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 H3F3AP84243 136 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 GABRA6Q16445 453 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 TMEM249Q2WGJ8 235 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 C6orf52Q5T4I8 152 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 ATAD3BQ5T9A4 648 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 CASP12Q6UXS9 341 aa10.62□□□□□ -0.71
CTIF-208ENST00000590422 MUC15Q8N387 334 aa10.62□□□□□ -0.71
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